RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 DBX1A6NMT0 343 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 PF4P02776 101 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 CYP7A1P22680 504 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 LMNB2Q03252 620 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 ZP2Q05996 745 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 PWP1Q13610 501 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 CDKAL1Q5VV42 579 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 LRRN4CLQ8ND94 238 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 RIN3Q8TB24 985 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 PRDM7Q9NQW5 492 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 WDR7Q9Y4E6 1490 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 PHLDB1Q86UU1 1377 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 H3BS24 57 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 PAPLNO95428 1278 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 PLCG1P19174 1290 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 SLC6A19Q695T7 634 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 SLC23A3Q6PIS1 610 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 CDH24Q86UP0 819 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 GIPC2Q8TF65 315 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 RHOVQ96L33 236 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 HSPA12BQ96MM6 686 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM74Q96NL1 305 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 CORINQ9Y5Q5 1042 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 F13A1P00488 732 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 ETV3P41162 512 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 FAM13CQ8NE31 585 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 GATAD2BQ8WXI9 593 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 CCNB3Q8WWL7 1395 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 TTC37Q6PGP7 1564 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 MINDY4BA8MYZ0 360 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 CILPO75339 1184 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 KIR3DL1P43629 444 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF124Q15973 351 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 LCE4AQ5TA78 99 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 RSRP1Q9BUV0 290 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 ABCC10Q5T3U5 1492 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-211ENST00000484135 MAPKBP1O60336 1514 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 YARSP54577 528 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 GOLM1Q8NBJ4 401 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 FAM168AQ92567 244 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 ATP13A1Q9HD20 1204 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 SEMA3GQ9NS98 782 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 TSPOAP1O95153 1857 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 ZBTB7CA1YPR0 619 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 FAM221AA4D161 298 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 TMCO4Q5TGY1 634 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 PCGF6Q9BYE7 350 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 KBTBD4Q9NVX7 518 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 KLHL3Q9UH77 587 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 MYOM3Q5VTT5 1437 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 GRIN3BO60391 1043 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 TNK2Q07912 1038 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 MPP2Q14168 576 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 THAP5Q7Z6K1 395 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 KSR1Q8IVT5 923 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 UBE2FQ969M7 185 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 ZSWIM5Q9P217 1185 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 ST14Q9Y5Y6 855 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 CD109Q6YHK3 1445 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 DIP2BQ9P265 1576 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 FGD6Q6ZV73 1430 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 UPK3BL1B0FP48 263 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 UPK3BL2E5RIL1 263 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 TNNI2P48788 182 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 DNAJB8Q8NHS0 232 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 SLC38A3Q99624 504 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 LMCD1Q9NZU5 365 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 REV1Q9UBZ9 1251 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 CEP131Q9UPN4 1083 aa7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms