RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	CEP95	Q96GE4	821 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	VCPKMT	Q9H867	229 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	SRRD	Q9UH36	339 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	CENPF	P49454	3210 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	NEDD4	P46934	1319 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP17L15	C9J2P7	530 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP17L11	C9JVI0	530 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP17L18	D6R9N7	530 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP17L22	D6RA61	530 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP17L19	D6RCP7	530 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP17L20	D6RJB6	530 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	NMT2	O60551	498 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	FCGRT	P55899	365 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP17L24	Q0WX57	530 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959		Q3C1V9	767 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	TICAM2	Q86XR7	235 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	PORCN	Q9H237	461 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	BTBD7	Q9P203	1132 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	ERVK-9	P63128	1117 aa		13.22	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	ERVK-24	P63145	666 aa		13.22	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		13.22	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARMC5	Q96C12	935 aa		13.22	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATG4C	Q96DT6	458 aa		13.22	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		13.22	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	TSPY3	P0CV98	308 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	TSPY8	P0CW00	308 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHML	P26374	656 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	TFAP4	Q01664	338 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDE4B	Q07343	736 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	LBX2	Q6XYB7	198 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	LPAR1	Q92633	364 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF333	Q96JL9	665 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	SH2D4A	Q9H788	454 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	NYAP2	Q9P242	653 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	RAD50	Q92878	1312 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	LCT	P09848	1927 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	POTEF	A5A3E0	1075 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	HIP1	O00291	1037 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	ORC4	O43929	436 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	RAD21	O60216	631 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	NDUFB10	O96000	172 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	GNRH1	P01148	92 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	FGR	P09769	529 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	ELN	P15502	786 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	FLT3LG	P49771	235 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	BRCA2	P51587	3418 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	TSPY2	A6NKD2	308 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	FLOT1	O75955	427 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	DSG3	P32926	999 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	PTH1R	Q03431	593 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARHGEF6	Q15052	776 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	MTFR1	Q15390	333 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	GOPC	Q9HD26	462 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	TOMM22	Q9NS69	142 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	TTLL1	O95922	423 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRMT2	P55345	433 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPR142	Q7Z601	462 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	RAET1E	Q8TD07	263 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	GJD2	Q9UKL4	321 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		13.18	□□□□□ -0.3

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