RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	21.03	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	21.03	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	EFCC1	Q9HA90	598 aa		21.03	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	GOPC	Q9HD26	462 aa		21.03	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		21.03	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	21.03	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		21.03	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	21.02	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	21.02	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		21.02	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	CEP95	Q96GE4	821 aa		21.02	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		21.02	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	VCPKMT	Q9H867	229 aa		21.02	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	SGSM2	O43147	1006 aa		21.01	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	ORC4	O43929	436 aa		21.01	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	21.01	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	BCR	P11274	1271 aa		21.01	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	SOX10	P56693	466 aa		21.01	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	HERVK_113	P62684	666 aa		21.01	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		21.01	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	21.01	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		21.01	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	LPAR1	Q92633	364 aa		21.01	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		21.01	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	21.01	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	NYAP2	Q9P242	653 aa		21.01	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		21.01	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	TTLL1	O95922	423 aa		21	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	PSMC4	P43686	418 aa		21	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	CAP1	Q01518	475 aa		21	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		21	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		21	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		21	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		21	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		21	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		20.99	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	PTH1R	Q03431	593 aa		20.99	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	CASC1	Q6TDU7	716 aa		20.99	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		20.99	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	NBPF3	Q9H094	633 aa		20.99	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	STX8	Q9UNK0	236 aa		20.99	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		20.99	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		20.99	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	NMT2	O60551	498 aa		20.98	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	20.98	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	FCGRT	P55899	365 aa		20.98	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		20.98	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	20.98	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		20.98	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	20.98	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	HTT	P42858	3142 aa		20.98	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		20.97	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902		F5H6K3	240 aa		20.97	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	20.97	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	PEX10	O60683	326 aa		20.97	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	FGR	P09769	529 aa		20.97	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	KLRC3	Q07444	240 aa		20.97	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		20.97	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	20.97	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	TRIM47	Q96LD4	638 aa		20.97	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	20.97	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	CDC45	O75419	566 aa		20.96	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	FLOT1	O75955	427 aa		20.96	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	COG2	Q14746	738 aa		20.96	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		20.96	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	20.96	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		20.96	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	ESR2	Q92731	530 aa		20.96	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		20.96	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		20.96	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	NEDD4	P46934	1319 aa		20.96	■□□□□ 0.95
USP19-210	ENST00000465902	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	20.95	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	NDUFB10	O96000	172 aa		20.95	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	GNRH1	P01148	92 aa		20.95	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	HOXD10	P28358	340 aa		20.95	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	CTGF	P29279	349 aa		20.95	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	MKL1	Q969V6	931 aa		20.95	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	20.95	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		20.95	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		20.95	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		20.95	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	MTMR7	Q9Y216	660 aa		20.95	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902		B4E1Z4	1266 aa		20.94	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	20.94	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		20.94	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		20.94	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	PARP14	Q460N5	1801 aa		20.94	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	RLF	Q13129	1914 aa		20.94	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	20.93	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	KDM4A	O75164	1064 aa		20.93	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	ERVK-9	P63128	1117 aa		20.93	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	ERVK-24	P63145	666 aa		20.93	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	SLFN13	Q68D06	897 aa		20.93	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	MAP4K1	Q92918	833 aa		20.93	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	COA7	Q96BR5	231 aa		20.93	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	ARMC5	Q96C12	935 aa		20.93	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		20.93	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	KRT23	Q9C075	422 aa		20.93	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		20.93	■□□□□ 0.94
USP19-210	ENST00000465902	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		20.93	■□□□□ 0.94

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