RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 STRNO43815 780 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-210ENST00000463041 PEX10O60683 326 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-210ENST00000463041 CNMDO75829 334 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-210ENST00000463041 AKR1B1P15121 316 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-210ENST00000463041 PTPREP23469 700 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-210ENST00000463041 RGS2P41220 211 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-210ENST00000463041 MORN1Q5T089 497 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-210ENST00000463041 TSHZ3Q63HK5 1081 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-210ENST00000463041 TICAM2Q86XR7 235 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-210ENST00000463041 MB21D1Q8N884 522 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-210ENST00000463041 PI4K2BQ8TCG2 481 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-210ENST00000463041 DPF3Q92784 378 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-210ENST00000463041 DEFB118Q96PH6 123 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-210ENST00000463041 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-210ENST00000463041 PORCNQ9H237 461 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-210ENST00000463041 VCPKMTQ9H867 229 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-210ENST00000463041 MKNK2Q9HBH9 465 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF287Q9HBT7 754 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-210ENST00000463041 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-210ENST00000463041 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 MINDY4BA8MYZ0 360 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 SMIM22K7EJ46 135 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 GPAA1O43292 621 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 SLC34A2O95436 690 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 APPP05067 770 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 EEF2P13639 858 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 MX1P20591 662 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 DSG3P32926 999 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 ICA1Q05084 483 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 MAP2K5Q13163 448 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 IFNL3Q8IZI9 196 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 TRIB2Q92519 343 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 NACAP1Q9BZK3 213 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 TANGO6Q9C0B7 1094 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 BTBD7Q9P203 1132 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 STAP2Q9UGK3 403 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 RLFQ13129 1914 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 SMCHD1A6NHR9 2005 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 WDR46O15213 610 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 FLOT1O75955 427 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 HOXC6P09630 235 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 RASA1P20936 1047 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 TDO2P48775 406 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 ATP2B2Q01814 1243 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 TRIM32Q13049 653 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 WDR78Q5VTH9 848 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 NECAB2Q7Z6G3 386 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 SHCBP1Q8NEM2 672 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 MKL1Q969V6 931 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 EVI5LQ96CN4 794 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 FSD1Q9BTV5 496 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 SPATC1LQ9H0A9 340 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 GOPCQ9HD26 462 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 NYAP2Q9P242 653 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 NR2E3Q9Y5X4 410 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 SALL3Q9BXA9 1300 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 DNAH12Q6ZR08 3092 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 H0YGN5 161 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 M0R2C6 588 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 SLC25A27O95847 323 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 PDE1AP54750 535 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 PDE4BQ07343 736 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 GRB14Q14449 540 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 MFSD14CQ5VZR4 134 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 DPP9Q86TI2 863 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 ABRAQ8N0Z2 381 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 SPICE1Q8N0Z3 855 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 APBA2Q99767 749 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 MROH8Q9H579 483 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 SLC5A4Q9NY91 659 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 OGDHLQ9ULD0 1010 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 MYH4Q9Y623 1939 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 F5H6K3 240 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 ERCC3P19447 782 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 KLRC3Q07444 240 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 PLS1Q14651 629 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 CCL14Q16627 93 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 CLEC10AQ8IUN9 316 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 ATG4CQ96DT6 458 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRF-210ENST00000463041 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms