RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461448.5

SNHG12-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-201ENST00000461448 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
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SNHG12-201ENST00000461448 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.94■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.94■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 C19orf81C9J6K1 198 aa22.93■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 NOVP48745 357 aa22.93■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 VEGFBP49765 207 aa22.93■■□□□ 1.26
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SNHG12-201ENST00000461448 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.93■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 FBXL16Q8N461 479 aa22.93■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.93■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.93■■□□□ 1.26
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SNHG12-201ENST00000461448 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
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SNHG12-201ENST00000461448 NOGQ13253 232 aa22.93■■□□□ 1.26
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SNHG12-201ENST00000461448 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.93■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 KAT14Q9H8E8 782 aa22.93■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 MTMR7Q9Y216 660 aa22.93■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.92■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 CETPP11597 493 aa22.92■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 LIFRP42702 1097 aa22.92■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 CCL15Q16663 113 aa22.92■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 ANKS1AQ92625 1134 aa22.92■■□□□ 1.26
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SNHG12-201ENST00000461448 GOPCQ9HD26 462 aa22.92■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.92■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.92■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.91■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.91■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 Q6ZUG5 572 aa22.91■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.91■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 ZIC5Q96T25 663 aa22.91■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 VCPKMTQ9H867 229 aa22.91■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 LY9Q9HBG7 655 aa22.91■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 SENP2Q9HC62 589 aa22.91■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 F5H6K3 240 aa22.9■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 KLRC3Q07444 240 aa22.9■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.9■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 PNMA1Q8ND90 353 aa22.9■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.9■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.9■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.9■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC69A6NI79 296 aa22.89■■□□□ 1.25
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SNHG12-201ENST00000461448 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.89■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 SLFN13Q68D06 897 aa22.89■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.89■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 NDUFB10O96000 172 aa22.88■■□□□ 1.25
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SNHG12-201ENST00000461448 MOGSQ13724 837 aa22.88■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.88■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 C12orf42Q96LP6 360 aa22.88■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 INHBEP58166 350 aa22.87■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.87■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 LPAR1Q92633 364 aa22.87■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 BRF1Q92994 677 aa22.87■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 VCAM1P19320 739 aa22.86■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 MAP2K2P36507 400 aa22.86■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 TREML2Q5T2D2 321 aa22.86■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.86■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 AK2P54819 239 aa22.86■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 PTPN18Q99952 460 aa22.86■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.86■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 MYH4Q9Y623 1939 aa22.86■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 BTBD19C9JJ37 291 aa22.85■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 SLC1A4P43007 532 aa22.85■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 APOBRQ0VD83 1088 aa22.85■■□□□ 1.25
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SNHG12-201ENST00000461448 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.85■■□□□ 1.25
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SNHG12-201ENST00000461448 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.85■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.85■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 CALM1P0DP23 149 aa22.84■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 CALM2P0DP24 149 aa22.84■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 CALM3P0DP25 149 aa22.84■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 TM4SF4P48230 202 aa22.84■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC96Q2M329 555 aa22.84■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.84■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 DCAF4Q8WV16 495 aa22.84■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 GMCL1Q96IK5 515 aa22.84■■□□□ 1.25
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