RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	GAK	O14976	1311 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	PPP1R2	P41236	205 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNQ4	P56696	695 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	UBASH3A	P57075	661 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	FANCC	Q00597	558 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	TEX11	Q8IYF3	940 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	BLID	Q8IZY5	108 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	CUEDC2	Q9H467	287 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	PRDM1	O75626	825 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	SKIL	P12757	684 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	KLRK1	P26718	216 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	PDE6B	P35913	854 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	PRPH	P41219	470 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	GPSM2	P81274	684 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	SPAG1	Q07617	926 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	NR5A1	Q13285	461 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	PNOC	Q13519	176 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	LONRF3	Q496Y0	759 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	IFNK	Q9P0W0	207 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	NPR1	P16066	1061 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	BTD	P43251	543 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	PLCD1	P51178	756 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	MORC3	Q14149	939 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	SOGA3	Q5TF21	947 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	SPATA20	Q8TB22	786 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	TNFRSF25	Q93038	417 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	AK8	Q96MA6	479 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	CLIC6	Q96NY7	704 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	CSRNP2	Q9H175	543 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	C6orf50	Q9HD87	102 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	C6orf229	H3BNL8	230 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	BIN1	O00499	593 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	ZSCAN12	O43309	604 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	TPM1	P09493	284 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	USP17L8	P0C7I0	530 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	NCAPH	Q15003	741 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	PTPN14	Q15678	1187 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	CFAP100	Q494V2	611 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	TMC6	Q7Z403	805 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	BARHL2	Q9NY43	387 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	PSME4	Q14997	1843 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-222	ENST00000459758	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		13.07	□□□□□ -0.32

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