RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439890.3

NANOGP9-201, Transcript of Nanog homeobox pseudogene 9, humanhuman

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Gene NANOGP9, Length 892 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP9-201ENST00000439890 PTPRKQ15262 1439 aa8.35□□□□□ -1.07
NANOGP9-201ENST00000439890 ASXL2Q76L83 1435 aa8.35□□□□□ -1.07
NANOGP9-201ENST00000439890 ROCK1Q13464 1354 aa8.35□□□□□ -1.07
NANOGP9-201ENST00000439890 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa8.34□□□□□ -1.07
NANOGP9-201ENST00000439890 CLSPNQ9HAW4 1339 aa8.34□□□□□ -1.07
NANOGP9-201ENST00000439890 PRR33A8MZF0 331 aa8.34□□□□□ -1.07
NANOGP9-201ENST00000439890 CYP7A1P22680 504 aa8.34□□□□□ -1.07
NANOGP9-201ENST00000439890 CAP2P40123 477 aa8.34□□□□□ -1.07
NANOGP9-201ENST00000439890 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
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NANOGP9-201ENST00000439890 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa8.34□□□□□ -1.07
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NANOGP9-201ENST00000439890 H3BS24 57 aa8.33□□□□□ -1.08
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NANOGP9-201ENST00000439890 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.33□□□□□ -1.08
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NANOGP9-201ENST00000439890 ADGBQ8N7X0 1667 aa8.33□□□□□ -1.08
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NANOGP9-201ENST00000439890 SHANK2Q9UPX8 1470 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 NAIPQ13075 1403 aa8.32□□□□□ -1.08
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NANOGP9-201ENST00000439890 CDH24Q86UP0 819 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 PHC3Q8NDX5 983 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 TMEM87BQ96K49 555 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 ATP13A1Q9HD20 1204 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 TJP2Q9UDY2 1190 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 TACC3Q9Y6A5 838 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 MAPKBP1O60336 1514 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 ADGRL2O95490 1459 aa8.32□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 CTSHP09668 335 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 CYB5RLQ6IPT4 315 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.31□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
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NANOGP9-201ENST00000439890 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 C22orf34Q6ZV56 151 aa8.3□□□□□ -1.08
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NANOGP9-201ENST00000439890 CCDC141Q6ZP82 1450 aa8.3□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 MBD5Q9P267 1494 aa8.3□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa8.29□□□□□ -1.08
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NANOGP9-201ENST00000439890 TSPY10P0CW01 314 aa8.29□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 PLCG1P19174 1290 aa8.29□□□□□ -1.08
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NANOGP9-201ENST00000439890 FAM13CQ8NE31 585 aa8.29□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 COX4I2Q96KJ9 171 aa8.29□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 USP31Q70CQ4 1352 aa8.29□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa8.29□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 MAST1Q9Y2H9 1570 aa8.29□□□□□ -1.08
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NANOGP9-201ENST00000439890 BCL11AQ9H165 835 aa8.28□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa8.28□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 ZSWIM5Q9P217 1185 aa8.28□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 ADAM30Q9UKF2 790 aa8.28□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.28□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 ABCC1P33527 1531 aa8.28□□□□□ -1.08
NANOGP9-201ENST00000439890 C9orf84Q5VXU9 1444 aa8.28□□□□□ -1.08
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NANOGP9-201ENST00000439890 KCNMB1Q16558 191 aa8.27□□□□□ -1.09
NANOGP9-201ENST00000439890 ZSWIM9Q86XI8 627 aa8.27□□□□□ -1.09
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NANOGP9-201ENST00000439890 LMCD1Q9NZU5 365 aa8.27□□□□□ -1.09
NANOGP9-201ENST00000439890 SYCP2Q9BX26 1530 aa8.27□□□□□ -1.09
NANOGP9-201ENST00000439890 GLI2P10070 1586 aa8.27□□□□□ -1.09
NANOGP9-201ENST00000439890 FANCAO15360 1455 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOGP9-201ENST00000439890 TNNI2P48788 182 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOGP9-201ENST00000439890 CHMP4BP1P59074 171 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOGP9-201ENST00000439890 THAP5Q7Z6K1 395 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOGP9-201ENST00000439890 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
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