RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428962.2

THBS3-202, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 2

Gene THBS3, Length 1,833 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-202ENST00000428962 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
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THBS3-202ENST00000428962 GRIN1Q05586 938 aa15.64■□□□□ 0.09
THBS3-202ENST00000428962 TTC38Q5R3I4 469 aa15.64■□□□□ 0.09
THBS3-202ENST00000428962 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
THBS3-202ENST00000428962 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
THBS3-202ENST00000428962 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
THBS3-202ENST00000428962 MKNK2Q9HBH9 465 aa15.64■□□□□ 0.09
THBS3-202ENST00000428962 SH3GLB2Q9NR46 395 aa15.64■□□□□ 0.09
THBS3-202ENST00000428962 MAN1B1Q9UKM7 699 aa15.64■□□□□ 0.09
THBS3-202ENST00000428962 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa15.63■□□□□ 0.09
THBS3-202ENST00000428962 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
THBS3-202ENST00000428962 TNNT1P13805 278 aa15.63■□□□□ 0.09
THBS3-202ENST00000428962 PLCG2P16885 1265 aa15.63■□□□□ 0.09
THBS3-202ENST00000428962 TFAP4Q01664 338 aa15.63■□□□□ 0.09
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THBS3-202ENST00000428962 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
THBS3-202ENST00000428962 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.63■□□□□ 0.09
THBS3-202ENST00000428962 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa15.63■□□□□ 0.09
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THBS3-202ENST00000428962 UFL1O94874 794 aa15.62■□□□□ 0.09
THBS3-202ENST00000428962 KCNJ6P48051 423 aa15.62■□□□□ 0.09
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THBS3-202ENST00000428962 ARID5BQ14865 1188 aa15.62■□□□□ 0.09
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THBS3-202ENST00000428962 PDCL3Q9H2J4 239 aa15.62■□□□□ 0.09
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THBS3-202ENST00000428962 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
THBS3-202ENST00000428962 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
THBS3-202ENST00000428962 HSD3B7Q9H2F3 369 aa15.61■□□□□ 0.09
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THBS3-202ENST00000428962 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
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THBS3-202ENST00000428962 PODXL2Q9NZ53 605 aa15.6■□□□□ 0.09
THBS3-202ENST00000428962 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
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THBS3-202ENST00000428962 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
THBS3-202ENST00000428962 BTDP43251 543 aa15.59■□□□□ 0.09
THBS3-202ENST00000428962 RBM10P98175 930 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
THBS3-202ENST00000428962 PTPN14Q15678 1187 aa15.59■□□□□ 0.09
THBS3-202ENST00000428962 ZNF174Q15697 407 aa15.59■□□□□ 0.09
THBS3-202ENST00000428962 CEP135Q66GS9 1140 aa15.59■□□□□ 0.09
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THBS3-202ENST00000428962 IL17RBQ9NRM6 502 aa15.59■□□□□ 0.09
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THBS3-202ENST00000428962 BLIDQ8IZY5 108 aa15.59■□□□□ 0.09
THBS3-202ENST00000428962 DYNLL2Q96FJ2 89 aa15.59■□□□□ 0.09
THBS3-202ENST00000428962 CRAMP1Q96RY5 1269 aa15.59■□□□□ 0.09
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THBS3-202ENST00000428962 LRRC37AA6NMS7 1700 aa15.58■□□□□ 0.09
THBS3-202ENST00000428962 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
THBS3-202ENST00000428962 ARMCX5Q6P1M9 558 aa15.58■□□□□ 0.08
THBS3-202ENST00000428962 NYAP1Q6ZVC0 841 aa15.58■□□□□ 0.08
THBS3-202ENST00000428962 USP49Q70CQ1 688 aa15.58■□□□□ 0.08
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