RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 NPHP1O15259 732 aa19.1■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 NR5A1Q13285 461 aa19.1■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 IQCA1Q86XH1 822 aa19.1■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 TNFRSF25Q93038 417 aa19.1■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 EXOC4Q96A65 974 aa19.1■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 TACC3Q9Y6A5 838 aa19.1■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 SCN7AQ01118 1682 aa19.1■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 CTAGE9A4FU28 777 aa19.09■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa19.09■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 MCM3P25205 808 aa19.09■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 GRIN1Q05586 938 aa19.09■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF662Q6ZS27 426 aa19.09■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 DHX58Q96C10 678 aa19.09■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 FUT8Q9BYC5 575 aa19.09■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 PARD6BQ9BYG5 372 aa19.09■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa19.09■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa19.09■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa19.08■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 ORC4O43929 436 aa19.08■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 PKN1Q16512 942 aa19.08■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 TTC38Q5R3I4 469 aa19.08■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 CYP26C1Q6V0L0 522 aa19.08■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 SYNE4Q8N205 404 aa19.08■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 ACBD3Q9H3P7 528 aa19.08■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 TOMM22Q9NS69 142 aa19.08■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 LRP2BPQ9P2M1 347 aa19.08■□□□□ 0.65
HCLS1-202ENST00000428394 CACNA1SQ13698 1873 aa19.08■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF831Q5JPB2 1677 aa19.08■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 MYH13Q9UKX3 1938 aa19.08■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 CALML3P27482 149 aa19.07■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 EIF5P55010 431 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 TMTC3Q6ZXV5 915 aa19.07■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 HDXQ7Z353 690 aa19.07■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 IQCDQ96DY2 449 aa19.07■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 SH3GLB2Q9NR46 395 aa19.07■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 CYP7A1P22680 504 aa19.06■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 LONP1P36776 959 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 RBL2Q08999 1139 aa19.06■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 E2F4Q16254 413 aa19.06■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 SPECC1Q5M775 1068 aa19.06■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 OXER1Q8TDS5 423 aa19.06■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 NUP133Q8WUM0 1156 aa19.06■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa19.06■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 BTG4Q9NY30 223 aa19.06■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 A0A1W2PQC6 194 aa19.06■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 OAS2P29728 719 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 PPP1R2P41236 205 aa19.06■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 SLC20A2Q08357 652 aa19.06■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 UBE4AQ14139 1066 aa19.06■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 LONRF2Q1L5Z9 754 aa19.06■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 RAD9BQ6WBX8 426 aa19.06■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 EHBP1Q8NDI1 1231 aa19.06■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 C8orf37Q96NL8 207 aa19.06■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 MAGEF1Q9HAY2 307 aa19.06■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 DOT1LQ8TEK3 1739 aa19.05■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 H7C1D1 291 aa19.05■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 PRKAB2O43741 272 aa19.05■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 GOLGA8FQ08AF8 430 aa19.05■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa19.05■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 TROAPQ12815 778 aa19.05■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 PAK1Q13153 545 aa19.05■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF827Q17R98 1081 aa19.05■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 NGLY1Q96IV0 654 aa19.05■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 SOWAHDA6NJG2 315 aa19.04■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 KCNB1Q14721 858 aa19.04■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC178Q5BJE1 867 aa19.04■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 GALNT17Q6IS24 598 aa19.04■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 SLC4A9Q96Q91 983 aa19.04■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 INCENPQ9NQS7 918 aa19.04■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa19.04■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 UBE2Q2LH0YL09 131 aa19.03■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 GYPCP04921 128 aa19.03■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 CD44P16070 742 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 PDXDC2PQ6P474 469 aa19.03■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa19.03■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 ABHD10Q9NUJ1 306 aa19.03■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC87Q9NVE4 849 aa19.03■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP19.03■□□□□ 0.64
HCLS1-202ENST00000428394 A0A087X0B3 334 aa19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.3 ms