RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 LPAR1Q92633 364 aa25.06■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 TMX2Q9Y320 296 aa25.06■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa25.05■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 ICA1Q05084 483 aa25.05■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 COG2Q14746 738 aa25.05■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa25.05■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 NECAB2Q7Z6G3 386 aa25.05■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa25.05■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF236Q9UL36 1845 aa25.05■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 SLC15A5A6NIM6 579 aa25.04■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 HOXC6P09630 235 aa25.04■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 PTPREP23469 700 aa25.04■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 GRB14Q14449 540 aa25.04■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 CCL14Q16627 93 aa25.04■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 CTR9Q6PD62 1173 aa25.04■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 PRO3102Q9H379 93 aa25.04■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 SH2D4AQ9H788 454 aa25.04■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 HOXC10Q9NYD6 342 aa25.04■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 CHRDL2Q6WN34 429 aa25.03■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 CLEC10AQ8IUN9 316 aa25.03■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 VCPKMTQ9H867 229 aa25.03■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 ALPK3Q96L96 1907 aa25.03■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa25.03■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 SBK1Q52WX2 424 aa25.02■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 GIMAP6Q6P9H5 292 aa25.02■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 MB21D1Q8N884 522 aa25.02■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 APPBP2Q92624 585 aa25.02■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 TANGO6Q9C0B7 1094 aa25.02■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.02■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 ROBO3Q96MS0 1386 aa25.02■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 EVI5O60447 810 aa25.01■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.01■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 OSBP2Q969R2 916 aa25.01■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 NBPF3Q9H094 633 aa25.01■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa25.01■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.01■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 PARP14Q460N5 1801 aa25■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 GSG1L2A8MUP6 293 aa25■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 WDR46O15213 610 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 IGHA2P01877 340 aa25■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 DSG3P32926 999 aa25■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 SHCBP1Q8NEM2 672 aa25■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 SPATC1LQ9H0A9 340 aa25■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 KANSL2Q9H9L4 492 aa25■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 WDR78Q5VTH9 848 aa24.99■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 LHX8Q68G74 356 aa24.99■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 FLRT1Q9NZU1 646 aa24.99■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 SPICE1Q8N0Z3 855 aa24.98■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 C11orf49Q9H6J7 331 aa24.98■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 STRNO43815 780 aa24.97■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 FLOT1O75955 427 aa24.97■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 EEF2P13639 858 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 MFSD14CQ5VZR4 134 aa24.97■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 PI4K2BQ8TCG2 481 aa24.97■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 FRMPD3Q5JV73 1810 aa24.96■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 GPAA1O43292 621 aa24.96■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 GNAT2P19087 354 aa24.96■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 NPLOC4Q8TAT6 608 aa24.96■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 ATG4CQ96DT6 458 aa24.96■■□□□ 1.59
UBXN4-204ENST00000426921 PFASO15067 1338 aa24.95■■□□□ 1.58
UBXN4-204ENST00000426921 COL6A1P12109 1028 aa24.95■■□□□ 1.58
UBXN4-204ENST00000426921 ERCC3P19447 782 aa24.95■■□□□ 1.58
UBXN4-204ENST00000426921 RASA1P20936 1047 aa24.95■■□□□ 1.58
UBXN4-204ENST00000426921 ADORA2AP29274 412 aa24.95■■□□□ 1.58
UBXN4-204ENST00000426921 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
UBXN4-204ENST00000426921 ABRAQ8N0Z2 381 aa24.95■■□□□ 1.58
UBXN4-204ENST00000426921 MROH8Q9H579 483 aa24.95■■□□□ 1.58
UBXN4-204ENST00000426921 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa24.95■■□□□ 1.58
UBXN4-204ENST00000426921 SZT2Q5T011 3432 aa24.94■■□□□ 1.58
UBXN4-204ENST00000426921 M0R2C6 588 aa24.94■■□□□ 1.58
UBXN4-204ENST00000426921 ERC2O15083 957 aa24.94■■□□□ 1.58
UBXN4-204ENST00000426921 OLFML2BQ68BL8 750 aa24.94■■□□□ 1.58
UBXN4-204ENST00000426921 GOPCQ9HD26 462 aa24.94■■□□□ 1.58
UBXN4-204ENST00000426921 SALL3Q9BXA9 1300 aa24.93■■□□□ 1.58
UBXN4-204ENST00000426921 A0A1W2PPC1 479 aa24.93■■□□□ 1.58
UBXN4-204ENST00000426921 ATP2B2Q01814 1243 aa24.93■■□□□ 1.58
UBXN4-204ENST00000426921 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
UBXN4-204ENST00000426921 MSCO60682 206 aa24.92■■□□□ 1.58
UBXN4-204ENST00000426921 CYBAP13498 195 aa24.91■■□□□ 1.58
UBXN4-204ENST00000426921 CYP2C19P33261 490 aa24.91■■□□□ 1.58
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM132BQ14DG7 1078 aa24.91■■□□□ 1.58
UBXN4-204ENST00000426921 DPP9Q86TI2 863 aa24.91■■□□□ 1.58
UBXN4-204ENST00000426921 C7orf61Q8IZ16 206 aa24.91■■□□□ 1.58
UBXN4-204ENST00000426921 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms