RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402182.7

APOBEC3B-203, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene APOBEC3B, Length 1,844 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3B-203ENST00000402182 GRM4Q14833 912 aa14.68□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.68□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 TTC38Q5R3I4 469 aa14.68□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa14.68□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 TRIML1Q8N9V2 468 aa14.68□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 POLLQ9UGP5 575 aa14.68□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 SERTAD1Q9UHV2 236 aa14.68□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 BRWD3Q6RI45 1802 aa14.68□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 LTBP1Q14766 1721 aa14.68□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
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APOBEC3B-203ENST00000402182 MFSD14BQ5SR56 506 aa14.67□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 ISM2Q6H9L7 571 aa14.67□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 SP8Q8IXZ3 490 aa14.67□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 TEX11Q8IYF3 940 aa14.67□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 DACH1Q9UI36 760 aa14.67□□□□□ -0.06
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APOBEC3B-203ENST00000402182 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.67□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 TXNRD1Q16881 649 aa14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 C16orf86Q6ZW13 317 aa14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 SMARCE1Q969G3 411 aa14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 IFNKQ9P0W0 207 aa14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 C6orf229H3BNL8 230 aa14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 CBFA2T2O43439 604 aa14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 RASA1P20936 1047 aa14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 SARSP49591 514 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 PLCD1P51178 756 aa14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 LZTS2Q9BRK4 669 aa14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 USP17L3A6NCW0 530 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 USP17L4A6NCW7 530 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 DYNC1I1O14576 645 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 FOXN1O15353 648 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 FANCCQ00597 558 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 USP17L1Q7RTZ2 530 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 MLKLQ8NB16 471 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 MYRIPQ8NFW9 859 aa14.65□□□□□ -0.06
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APOBEC3B-203ENST00000402182 MAD2L2Q9UI95 211 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 MAN1B1Q9UKM7 699 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3B-203ENST00000402182 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa14.65□□□□□ -0.06
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APOBEC3B-203ENST00000402182 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 CDK8P49336 464 aa14.64□□□□□ -0.07
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APOBEC3B-203ENST00000402182 ZNF174Q15697 407 aa14.64□□□□□ -0.07
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APOBEC3B-203ENST00000402182 BLIDQ8IZY5 108 aa14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 PDILTQ8N807 584 aa14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 CCDC150Q8NCX0 1101 aa14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 SPATA20Q8TB22 786 aa14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 HSD3B7Q9H2F3 369 aa14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 SLFN14P0C7P3 912 aa14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 PTGDRQ13258 359 aa14.64□□□□□ -0.07
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APOBEC3B-203ENST00000402182 USP49Q70CQ1 688 aa14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 PROM2Q8N271 834 aa14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 EYA3Q99504 573 aa14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.64□□□□□ -0.07
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APOBEC3B-203ENST00000402182 STX8Q9UNK0 236 aa14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 NRXN2Q9P2S2 1712 aa14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 SNED1Q8TER0 1413 aa14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 PRR29P0C7W0 189 aa14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 SKILP12757 684 aa14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 BMP6P22004 513 aa14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 TMC6Q7Z403 805 aa14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 STAG2Q8N3U4 1231 aa14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 DAGLBQ8NCG7 672 aa14.63□□□□□ -0.07
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APOBEC3B-203ENST00000402182 EPSTI1Q96J88 318 aa14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 FOCADQ5VW36 1801 aa14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 WNT7AO00755 349 aa14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 NRDCO43847 1150 aa14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 SERPINC1P01008 464 aa14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 NPR1P16066 1061 aa14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 CCZ1BP86790 482 aa14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3B-203ENST00000402182 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
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