RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 VCAM1P19320 739 aa35.49■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 HSPA4P34932 840 aa35.49■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 NCOA7Q8NI08 942 aa35.49■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 FOXN1O15353 648 aa35.48■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 CRHR2Q13324 411 aa35.48■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa35.48■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 CYB5R4Q7L1T6 521 aa35.48■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 C8orf34Q49A92 452 aa35.47■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 RCSD1Q6JBY9 416 aa35.47■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 SPICE1Q8N0Z3 855 aa35.47■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 KCNB2Q92953 911 aa35.47■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 TSGA10IPQ3SY00 556 aa35.47■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 IQCA1Q86XH1 822 aa35.47■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 LPAR1Q92633 364 aa35.47■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa35.47■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 CYP2C8P10632 490 aa35.46■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 GOPCQ9HD26 462 aa35.46■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 F5H6K3 240 aa35.45■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 SEC24BO95487 1268 aa35.45■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 KLRC3Q07444 240 aa35.45■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP35.45■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa35.45■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 TTC14Q96N46 770 aa35.44■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM47Q9BQJ4 181 aa35.43■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 RAD21O60216 631 aa35.42■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 NDUFB10O96000 172 aa35.42■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 DGKHQ86XP1 1220 aa35.42■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa35.42■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 TNKSO95271 1327 aa35.42■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 USP17L15C9J2P7 530 aa35.42■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 USP17L13C9JLJ4 530 aa35.42■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 USP17L11C9JVI0 530 aa35.42■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 USP17L18D6R9N7 530 aa35.42■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 USP17L22D6RA61 530 aa35.42■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 USP17L17D6RBQ6 530 aa35.42■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 USP17L19D6RCP7 530 aa35.42■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 USP17L20D6RJB6 530 aa35.42■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 ANTXR2P58335 489 aa35.42■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 USP17L24Q0WX57 530 aa35.42■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 ADCK5Q3MIX3 580 aa35.42■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC178Q5BJE1 867 aa35.42■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa35.42■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 CHST3Q7LGC8 479 aa35.42■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 UBAC1Q9BSL1 405 aa35.42■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 PNMA3Q9UL41 463 aa35.42■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 TLR2O60603 784 aa35.41■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 TOP1P11387 765 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 OSBPP22059 807 aa35.41■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 SNX14Q9Y5W7 946 aa35.41■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 ADGRA2Q96PE1 1338 aa35.4■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 WDR46O15213 610 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 ANKS1AQ92625 1134 aa35.4■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
PKDCC-202ENST00000401498 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 KRT32Q14532 448 aa35.38■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 SEC23AQ15436 765 aa35.38■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 SLFN13Q68D06 897 aa35.38■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 NEK1Q96PY6 1258 aa35.38■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 RLFQ13129 1914 aa35.38■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 FAM83BQ5T0W9 1011 aa35.38■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 TANGO6Q9C0B7 1094 aa35.38■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 PARP14Q460N5 1801 aa35.37■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 GPR25O00155 361 aa35.36■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 MCM5P33992 734 aa35.36■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 C17orf99Q6UX52 265 aa35.36■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 LBX1P52954 281 aa35.35■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 HERVK_113P62684 666 aa35.35■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 RASGRP2Q7LDG7 609 aa35.35■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 CHMP4CQ96CF2 233 aa35.35■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 CPA4Q9UI42 421 aa35.35■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 PRC1O43663 620 aa35.34■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 MCCP23508 829 aa35.34■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa35.34■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 GMCL1Q96IK5 515 aa35.34■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 MTMR7Q9Y216 660 aa35.34■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 POTEEQ6S8J3 1075 aa35.34■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 COG2Q14746 738 aa35.33■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 KAT14Q9H8E8 782 aa35.33■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 SENP2Q9HC62 589 aa35.33■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 FBXO28Q9NVF7 368 aa35.33■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms