RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000388782.8

GKAP1-204, Transcript of G kinase anchoring protein 1, human

TSL 2

Gene GKAP1, Length 1,231 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GKAP1-204	ENST00000388782	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		29.07	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	GOPC	Q9HD26	462 aa		29.07	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	NOG	Q13253	232 aa		29.06	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		29.06	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		29.06	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		29.06	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	PTPRF	P10586	1907 aa		29.06	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	CAPN15	O75808	1086 aa		29.05	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	CETP	P11597	493 aa		29.05	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	TMTC2	Q8N394	836 aa		29.05	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		29.05	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	KAT14	Q9H8E8	782 aa		29.05	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		29.05	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		29.04	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	CPA1	P15085	419 aa		29.04	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	LIFR	P42702	1097 aa		29.04	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	FGD1	P98174	961 aa		29.04	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	GRM1	Q13255	1194 aa		29.04	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		29.04	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	LPAR1	Q92633	364 aa		29.04	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	C12orf42	Q96LP6	360 aa		29.04	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	VCPKMT	Q9H867	229 aa		29.04	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	HMGCS2	P54868	508 aa		29.03	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	FBXL16	Q8N461	479 aa		29.03	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		29.03	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		29.03	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	LY9	Q9HBG7	655 aa		29.03	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	IL27	Q8NEV9	243 aa		29.02	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		29.02	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	KIF2C	Q99661	725 aa		29.02	■■■□□ 2.24
GKAP1-204	ENST00000388782	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		29.01	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	INHBE	P58166	350 aa		29.01	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	SREBF2	Q12772	1141 aa		29.01	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	RABEP1	Q15276	862 aa		29.01	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	CCL15	Q16663	113 aa		29.01	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	PNMA1	Q8ND90	353 aa		29.01	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		29.01	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		29.01	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782		F5H6K3	240 aa		29	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	VEGFB	P49765	207 aa		29	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	KLRC3	Q07444	240 aa		29	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		29	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782		Q6ZUG5	572 aa		29	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		29	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		29	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		29	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	CCDC69	A6NI79	296 aa		28.99	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	RAD21	O60216	631 aa		28.99	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	NDUFB10	O96000	172 aa		28.99	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		28.99	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	NEK4	P51957	841 aa		28.98	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	SLFN13	Q68D06	897 aa		28.98	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		28.98	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		28.98	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	GMCL1	Q96IK5	515 aa		28.98	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	28.98	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	VCAM1	P19320	739 aa		28.97	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	MAP2K2	P36507	400 aa		28.97	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	MOGS	Q13724	837 aa		28.97	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	ANKRD1	Q15327	319 aa		28.97	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	DCAF4	Q8WV16	495 aa		28.97	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	SENP2	Q9HC62	589 aa		28.97	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		28.97	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	DDAH1	O94760	285 aa		28.96	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	28.96	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		28.96	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		28.96	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	BRF1	Q92994	677 aa		28.96	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		28.96	■■■□□ 2.23
GKAP1-204	ENST00000388782	AOC2	O75106	756 aa		28.95	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	SLC1A4	P43007	532 aa		28.95	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	DGKZ	Q13574	1117 aa		28.95	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		28.95	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		28.95	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		28.95	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	FOXN1	O15353	648 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	CALM1	P0DP23	149 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	CALM2	P0DP24	149 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	CALM3	P0DP25	149 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	PDHB	P11177	359 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22

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