RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377107.6

USP11-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP11, Length 3,515 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-204ENST00000377107 KIF5CO60282 957 aa14.64□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 RHOXF2BP0C7M4 288 aa14.64□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 SCG2P13521 617 aa14.64□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 NGLY1Q96IV0 654 aa14.64□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 MED15Q96RN5 788 aa14.64□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.64□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 RHOXF2Q9BQY4 288 aa14.64□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 TRIM49BA6NDI0 452 aa14.64□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 F8W031 263 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 EIF6P56537 245 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 UBXN1Q04323 297 aa14.64□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 AMOTL1Q8IY63 956 aa14.64□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 HINFPQ9BQA5 517 aa14.64□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 TROAPQ12815 778 aa14.63□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 UBE4AQ14139 1066 aa14.63□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 SPATA1Q5VX52 437 aa14.63□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 TRIM65Q6PJ69 517 aa14.63□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.63□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.63□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 NWD2Q9ULI1 1742 aa14.63□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 MCM6Q14566 821 aa14.63□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 SKIDA1Q1XH10 827 aa14.63□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 LETM2Q2VYF4 491 aa14.63□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 PNMA1Q8ND90 353 aa14.63□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 NELFBQ8WX92 580 aa14.63□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.63□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 ZNF446Q9NWS9 450 aa14.63□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 STX10O60499 249 aa14.62□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 SYCP1Q15431 976 aa14.62□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.62□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 LINC00116Q8NCU8 138 aa14.62□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 TRIM47Q96LD4 638 aa14.62□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 TJP1Q07157 1748 aa14.62□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 KIF5BP33176 963 aa14.62□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 FANCGO15287 622 aa14.62□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 CALM1P0DP23 149 aa14.62□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 CALM2P0DP24 149 aa14.62□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 CALM3P0DP25 149 aa14.62□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 KRT9P35527 623 aa14.62□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 RAD9BQ6WBX8 426 aa14.62□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 ZNF384Q8TF68 577 aa14.62□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 TFR2Q9UP52 801 aa14.62□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 MARCH6O60337 910 aa14.61□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 LDHBP07195 334 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 GYS2P54840 703 aa14.61□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 DPYDQ12882 1025 aa14.61□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 FERMT2Q96AC1 680 aa14.61□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 PARP3Q9Y6F1 533 aa14.61□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 PAK1Q13153 545 aa14.61□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.61□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 DTHD1Q6ZMT9 781 aa14.61□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 AK7Q96M32 723 aa14.61□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.6□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 PICALMQ13492 652 aa14.6□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 KRT31Q15323 416 aa14.6□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 BLIDQ8IZY5 108 aa14.6□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 L2HGDHQ9H9P8 463 aa14.6□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.6□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 PKD1L3Q7Z443 1732 aa14.6□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 NAPAP54920 295 aa14.6□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 NR1I3Q14994 352 aa14.6□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.6□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 ABL1P00519 1130 aa14.59□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa14.59□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 TRIML1Q8N9V2 468 aa14.59□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.59□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.59□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.59□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 KCNJ18B7U540 433 aa14.59□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 ENC1O14682 589 aa14.59□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 PHACTR2O75167 634 aa14.59□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 ZNF18P17022 549 aa14.59□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 SARSP49591 514 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 KCNJ12Q14500 433 aa14.59□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 ATRNO75882 1429 aa14.59□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 RPN1P04843 607 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 IDEP14735 1019 aa14.59□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 SLC35F6Q8N357 371 aa14.59□□□□□ -0.07
USP11-204ENST00000377107 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms