RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330149.9

TRAPPC6B-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6B, Length 3,242 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6B-201ENST00000330149 EPHA10Q5JZY3 1008 aa6.71□□□□□ -1.33
TRAPPC6B-201ENST00000330149 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
TRAPPC6B-201ENST00000330149 NKX2-3Q8TAU0 364 aa6.71□□□□□ -1.33
TRAPPC6B-201ENST00000330149 DRC1Q96MC2 740 aa6.71□□□□□ -1.33
TRAPPC6B-201ENST00000330149 F6X3S4 739 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 KIF20AO95235 890 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 UBXN2AP68543 259 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 CCDC183Q5T5S1 534 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.71□□□□□ -1.34
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 ECM29Q5VYK3 1845 aa6.71□□□□□ -1.34
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 TRIM32Q13049 653 aa6.71□□□□□ -1.34
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 LMBR1LQ6UX01 489 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 CHD7Q9P2D1 2997 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 RECKO95980 971 aa6.7□□□□□ -1.34
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 UVSSAQ2YD98 709 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 MYO9BQ13459 2157 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 LAMB1P07942 1786 aa6.7□□□□□ -1.34
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 CSF1RP07333 972 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 HOXD10P28358 340 aa6.7□□□□□ -1.34
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 PPIL2Q13356 520 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 TCEAL1Q15170 157 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 STK32AQ8WU08 396 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 A6NJR5 290 aa6.69□□□□□ -1.34
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 MAFGO15525 162 aa6.69□□□□□ -1.34
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 STK31Q9BXU1 1019 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 SMC3Q9UQE7 1217 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.69□□□□□ -1.34
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 VPS37DQ86XT2 251 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 STAG1Q8WVM7 1258 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 MEIS3Q99687 375 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 ADGRA2Q96PE1 1338 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 BCRP11274 1271 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 PRMT2P55345 433 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 DIXDC1Q155Q3 683 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 CEP85Q6P2H3 762 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.68□□□□□ -1.34
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 SLAIN1Q8ND83 568 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 LRRC27Q9C0I9 530 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 CHST12Q9NRB3 414 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 PALD1Q9ULE6 856 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 TPM3P06753 285 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 PDE1AP54750 535 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 PPATQ06203 517 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 CCDC57Q2TAC2 916 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 GPAT2Q6NUI2 795 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 KLHDC4Q8TBB5 520 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 TEKT1Q969V4 418 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 SPACA7Q96KW9 195 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 PYCARDQ9ULZ3 195 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC6B-201ENST00000330149 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.68□□□□□ -1.34
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