RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321358.11

YBX1-201, Transcript of Y-box binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene YBX1, Length 1,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1-201ENST00000321358 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 PNMA1Q8ND90 353 aa24.76■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.76■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa24.76■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 TMOD4Q9NZQ9 345 aa24.76■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 TRPM7Q96QT4 1865 aa24.76■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 A0A1W2PRG0 241 aa24.76■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 SGMS1Q86VZ5 419 aa24.76■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 WNK4Q96J92 1243 aa24.76■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 AGXT2Q9BYV1 514 aa24.76■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 AK2P54819 239 aa24.75■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 SNAPC2Q13487 334 aa24.75■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 SPRYD7Q5W111 196 aa24.75■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.75■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa24.75■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 MYH8P13535 1937 aa24.74■■□□□ 1.55
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YBX1-201ENST00000321358 CALM1P0DP23 149 aa24.74■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 CALM2P0DP24 149 aa24.74■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 CALM3P0DP25 149 aa24.74■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 DEFB115Q30KQ5 88 aa24.74■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa24.74■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 VCPKMTQ9H867 229 aa24.74■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 MTMR7Q9Y216 660 aa24.74■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 F5H6K3 240 aa24.73■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 MCM2P49736 904 aa24.73■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 GTF2A2P52657 109 aa24.73■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 KLRC3Q07444 240 aa24.73■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 APOBRQ0VD83 1088 aa24.73■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 ZNF654Q8IZM8 581 aa24.73■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 LPAR1Q92633 364 aa24.73■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 SENP2Q9HC62 589 aa24.73■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 KCNH4Q9UQ05 1017 aa24.73■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 HMGCS2P54868 508 aa24.72■■□□□ 1.55
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YBX1-201ENST00000321358 SLFN13Q68D06 897 aa24.72■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 RASAL3Q86YV0 1011 aa24.72■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 NUP133Q8WUM0 1156 aa24.72■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 DOCK1Q14185 1865 aa24.72■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 ZBTB43O43298 467 aa24.71■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 DDAH1O94760 285 aa24.71■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 SLC1A4P43007 532 aa24.71■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa24.71■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 RASSF10A6NK89 507 aa24.71■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 SLC10A3P09131 477 aa24.71■■□□□ 1.55
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YBX1-201ENST00000321358 GJA5P36382 358 aa24.71■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 GRM1Q13255 1194 aa24.71■■□□□ 1.55
YBX1-201ENST00000321358 SH3D19Q5HYK7 790 aa24.71■■□□□ 1.55
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YBX1-201ENST00000321358 SPICE1Q8N0Z3 855 aa24.71■■□□□ 1.55
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YBX1-201ENST00000321358 KIF5BP33176 963 aa24.7■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 GADL1Q6ZQY3 521 aa24.7■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 MICU3Q86XE3 530 aa24.7■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 DCAF4Q8WV16 495 aa24.7■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 GMCL1Q96IK5 515 aa24.7■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.7■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.7■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 RCAN1P53805 252 aa24.69■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 EVCP57679 992 aa24.69■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 CCDC96Q2M329 555 aa24.69■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 C12orf42Q96LP6 360 aa24.69■■□□□ 1.54
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YBX1-201ENST00000321358 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 TROAPQ12815 778 aa24.68■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 CHMP4CQ96CF2 233 aa24.68■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 MAP3K14Q99558 947 aa24.68■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 MYL10Q9BUA6 226 aa24.68■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa24.67■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 WDR46O15213 610 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 PDHBP11177 359 aa24.67■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 BMP3P12645 472 aa24.67■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.541e-34■■■■□ 22.4
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YBX1-201ENST00000321358 CYP4F22Q6NT55 531 aa24.67■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 OTOFQ9HC10 1997 aa24.67■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa24.66■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 GOLGA8AA7E2F4 631 aa24.66■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 VCAM1P19320 739 aa24.66■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 INHBEP58166 350 aa24.66■■□□□ 1.54
YBX1-201ENST00000321358 NOGQ13253 232 aa24.66■■□□□ 1.54
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