RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 TSGA10IPQ3SY00 556 aa26.3■■□□□ 1.8
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HOXD4-201ENST00000306324 C12orf42Q96LP6 360 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD4-201ENST00000306324 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
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HOXD4-201ENST00000306324 RNF186Q9NXI6 227 aa26.29■■□□□ 1.8
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HOXD4-201ENST00000306324 F5H6K3 240 aa26.27■■□□□ 1.8
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HOXD4-201ENST00000306324 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
HOXD4-201ENST00000306324 LPAR1Q92633 364 aa26.27■■□□□ 1.8
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HOXD4-201ENST00000306324 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
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HOXD4-201ENST00000306324 MTMR7Q9Y216 660 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD4-201ENST00000306324 ERICH2A1L162 156 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXD4-201ENST00000306324 PRC1O43663 620 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXD4-201ENST00000306324 ANTXR2P58335 489 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXD4-201ENST00000306324 CHMP4CQ96CF2 233 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXD4-201ENST00000306324 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
HOXD4-201ENST00000306324 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXD4-201ENST00000306324 PARP14Q460N5 1801 aa26.25■■□□□ 1.79
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HOXD4-201ENST00000306324 TANGO6Q9C0B7 1094 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD4-201ENST00000306324 PNMA3Q9UL41 463 aa26.24■■□□□ 1.79
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HOXD4-201ENST00000306324 USP17L13C9JLJ4 530 aa26.23■■□□□ 1.79
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HOXD4-201ENST00000306324 USP17L17D6RBQ6 530 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD4-201ENST00000306324 USP17L19D6RCP7 530 aa26.23■■□□□ 1.79
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HOXD4-201ENST00000306324 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
HOXD4-201ENST00000306324 USP17L24Q0WX57 530 aa26.23■■□□□ 1.79
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HOXD4-201ENST00000306324 FAM83BQ5T0W9 1011 aa26.23■■□□□ 1.79
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HOXD4-201ENST00000306324 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXD4-201ENST00000306324 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
HOXD4-201ENST00000306324 PNMA1Q8ND90 353 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXD4-201ENST00000306324 TCEANC2Q96MN5 208 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXD4-201ENST00000306324 RASGRP2Q7LDG7 609 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD4-201ENST00000306324 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM87BQ96K49 555 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD4-201ENST00000306324 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD4-201ENST00000306324 SLC1A4P43007 532 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXD4-201ENST00000306324 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
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