RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 KLC4Q9NSK0 619 aa16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRIM49BA6NDI0 452 aa16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 MYO1BO43795 1136 aa16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC57Q2TAC2 916 aa16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 C8orf74Q6P047 294 aa16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC42Q96M95 316 aa16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM184BQ9ULE4 1060 aa16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 CHUKO15111 745 aa16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 AKR1B10O60218 316 aa16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 PDHBP11177 359 aa16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 HAUS4Q9H6D7 363 aa16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 SH3TC1Q8TE82 1336 aa16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRIM75PA6NK02 468 aa16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 ARHGAP25P42331 645 aa16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 WDR93Q6P2C0 686 aa16.48■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 ROBO2Q9HCK4 1378 aa16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLEKHG3A1L390 1219 aa16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 VAV2P52735 878 aa16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 BIRC2Q13490 618 aa16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 LACRTQ9GZZ8 138 aa16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZMYM6O95789 1325 aa16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 MINDY4BA8MYZ0 360 aa16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 NCK2O43639 380 aa16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 BUB1O43683 1085 aa16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 HOXB7P09629 217 aa16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 NFU1Q9UMS0 254 aa16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 CEP131Q9UPN4 1083 aa16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 GDAQ9Y2T3 454 aa16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 AGPSO00116 658 aa16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRT83P78385 493 aa16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 MAP3K14Q99558 947 aa16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 NAPBQ9H115 298 aa16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 BABAM1Q9NWV8 329 aa16.47■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 GOLGA8KD6RF30 607 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 GCKP35557 465 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 TYW1BQ6NUM6 668 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 GUCY2DQ02846 1103 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 PAK1Q13153 545 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 RTN1Q16799 776 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 NFRKBQ6P4R8 1299 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 VIPAS39Q9H9C1 493 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 LRWD1Q9UFC0 647 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 USP6P35125 1406 aa16.46■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 SCARF1Q14162 830 aa16.46■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 RILPL1Q5EBL4 403 aa16.46■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 PAGE5Q96GU1 130 aa16.46■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 MLXIPQ9HAP2 919 aa16.46■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 MOCS3O95396 460 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 CDC25CP30307 473 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 MCM7P33993 719 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 TBC1D10CQ8IV04 446 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 KLHL7Q8IXQ5 586 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 PTPREP23469 700 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 ARID5AQ03989 594 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 KCNG1Q9UIX4 513 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 UBN2Q6ZU65 1347 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 B4DLN1 442 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 USO1O60763 962 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 TACC1O75410 805 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 NKX2-3Q8TAU0 364 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 XAGE2Q96GT9 111 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 AGXT2Q9BYV1 514 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 TANGO6Q9C0B7 1094 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 EPB41L5Q9HCM4 733 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 HAUS2Q9NVX0 235 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 LMTK2Q8IWU2 1503 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 SMIM23A6NLE4 172 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 CPP00450 1065 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 MMP14P50281 582 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 SNCBQ16143 134 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 CPLX4Q7Z7G2 160 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC51Q96ER9 411 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 PIK3C2BO00750 1634 aa16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms