RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
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PANX1-201ENST00000227638 UTRNP46939 3433 aa20.57■□□□□ 0.88
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PANX1-201ENST00000227638 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PANX1-201ENST00000227638 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PANX1-201ENST00000227638 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.57■□□□□ 0.88
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PANX1-201ENST00000227638 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
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PANX1-201ENST00000227638 ZNF569Q5MCW4 686 aa20.56■□□□□ 0.88
PANX1-201ENST00000227638 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.56■□□□□ 0.88
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PANX1-201ENST00000227638 KCNJ6P48051 423 aa20.55■□□□□ 0.88
PANX1-201ENST00000227638 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PANX1-201ENST00000227638 KRT31Q15323 416 aa20.55■□□□□ 0.88
PANX1-201ENST00000227638 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa20.55■□□□□ 0.88
PANX1-201ENST00000227638 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PANX1-201ENST00000227638 NGLY1Q96IV0 654 aa20.55■□□□□ 0.88
PANX1-201ENST00000227638 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.55■□□□□ 0.88
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