RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000043498.7

Hdac3-201, Transcript of Histone deacetylase 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hdac3, Length 2,004 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Fam83aQ8K2P2 436 aa26.8■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Slc18a1Q8R090 521 aa26.8■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Tdrd1Q99MV1 1172 aa26.8■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Cep89Q9CZX2 791 aa26.8■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Dicer1Q8R418 1916 aa26.8■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Lca5lQ8C0X0 741 aa26.8■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ccdc178Q8CDV0 866 aa26.8■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Col11a1Q61245 1804 aa26.79■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ppef2O35385 757 aa26.79■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Lrrc2Q8VDB8 371 aa26.79■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Tfap4Q9JIZ5 338 aa26.79■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Zfp804bA0A0G2JGH6 1343 aa26.79■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Rgs9O54828 675 aa26.78■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Otud5Q3U2S4 566 aa26.78■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Armc2Q3URY6 854 aa26.78■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ttbk2Q3UVR3 1243 aa26.78■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Rasa3Q60790 834 aa26.78■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Lrrc15Q80X72 579 aa26.78■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 U2af1l4Q8BGJ9 220 aa26.78■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Kiaa1524Q8BWY9 907 aa26.78■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Epha10Q8BYG9 1007 aa26.78■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Gripap1Q8VD04 806 aa26.78■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Gmcl1Q920G9 524 aa26.78■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Sall1Q9ER74 1322 aa26.78■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Oog1E9Q5G7 496 aa26.78■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 GnaqP21279 359 aa26.78■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Sfi1Q3UZY0 1216 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Nsrp1Q5NCR9 542 aa26.78■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Me3Q8BMF3 604 aa26.78■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Cep57l1Q8VDS7 400 aa26.78■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Gpaa1Q9WTK3 621 aa26.78■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Gm44503E9PYU5 387 aa26.77■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Nfil3O08750 462 aa26.77■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Defb15Q8R2I5 79 aa26.77■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Dnaaf4Q8R368 420 aa26.77■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Bloc1s2Q9CWG9 143 aa26.77■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Mettl16Q9CQG2 553 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 EhhadhQ9DBM2 718 aa26.77■■□□□ 1.88
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Cfap99A0A140LIX9 648 aa26.76■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Mms22lB1AUR6 1238 aa26.76■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Myo19Q5SV80 963 aa26.76■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Zkscan1Q8BGS3 561 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Il31raQ8K5B1 716 aa26.76■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Vmn1r199Q8R280 367 aa26.76■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ero1bQ8R2E9 467 aa26.76■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Trim59Q922Y2 403 aa26.76■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Cbx2P30658 519 aa26.75■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Rfc4Q99J62 364 aa26.75■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 ZwintQ9CQU5 252 aa26.75■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Aox1O54754 1333 aa26.75■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Brca1P48754 1812 aa26.75■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Arl14Q3SXC5 192 aa26.75■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Sp4Q62445 782 aa26.75■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Slitrk3Q810B9 980 aa26.75■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Lzts2Q91YU6 671 aa26.75■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Stk39Q9Z1W9 556 aa26.75■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Zbtb21E9Q444 1094 aa26.74■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Magea8O89012 320 aa26.74■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 FosbP13346 338 aa26.74■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Lilrb3P97484 841 aa26.74■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Grm4Q68EF4 912 aa26.74■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Dcaf15Q6PFH3 600 aa26.74■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Slc4a7Q8BTY2 1034 aa26.74■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Bst2Q8R2Q8 172 aa26.74■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Tm4sf4Q91XD3 202 aa26.74■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Mrpl44Q9CY73 333 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Eif4enif1Q9EST3 983 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Usp14Q9JMA1 493 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Arrdc4A0A0B4J1F4 415 aa26.73■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Slain1Q68FF7 579 aa26.73■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Clca4aQ6Q473 924 aa26.73■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Bri3bpQ8BXV2 253 aa26.73■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Inpp4aQ9EPW0 939 aa26.73■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Zscan20B2KFW1 1030 aa26.73■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Serpinb2P12388 415 aa26.73■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Mboat4P0C7A3 435 aa26.72■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Sh2d1b2Q45HK4 132 aa26.72■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Cog5Q8C0L8 829 aa26.72■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Terf2ipQ91VL8 393 aa26.72■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Prpf3Q922U1 683 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Cdc45Q9Z1X9 566 aa26.72■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 MycbpapQ5SUV2 932 aa26.72■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Pdcd6ipQ9WU78 869 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Homer1Q9Z2Y3 366 aa26.72■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Dock2Q8C3J5 1828 aa26.71■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Mx1P09922 631 aa26.71■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 OsbpQ3B7Z2 805 aa26.71■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Gm5114W4VSN8 858 aa26.71■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Tbc1d8bA3KGB4 1114 aa26.7■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 HunkO88866 714 aa26.7■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 BC048507Q80ZS7 89 aa26.7■■□□□ 1.87
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Pus7B7ZNL8 666 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 OatP29758 439 aa26.7■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Vmn1r209Q5NC97 312 aa26.7■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Fbxo28Q8BIG4 368 aa26.7■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Gtf3c5Q8R2T8 520 aa26.7■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 ArcQ9WV31 396 aa26.7■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Atoh1P48985 351 aa26.69■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Cpa2Q504N0 417 aa26.69■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Stxbp3Q60770 592 aa26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.8 ms