RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027367.13

Ctdsp1-201, Transcript of Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdsp1, Length 2,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Ppef2O35385 757 aa22.96■■□□□ 1.27
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Cdk4P30285 303 aa22.96■■□□□ 1.27
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Ces3aQ63880 571 aa22.96■■□□□ 1.27
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Ces3bQ8VCU1 571 aa22.96■■□□□ 1.27
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Polr2dQ9D7M8 142 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Wdr64Q9D565 1086 aa22.96■■□□□ 1.27
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Grin2dQ03391 1323 aa22.96■■□□□ 1.27
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Gm43738A0A0G2JEA5 862 aa22.95■■□□□ 1.27
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Lcmt1A0A0U1RNF2 332 aa22.95■■□□□ 1.27
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Nbr1P97432 988 aa22.95■■□□□ 1.27
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Apobec3Q99J72 440 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.27
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Serpinb6bO08804 377 aa22.95■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Pex1Q5BL07 1284 aa22.95■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Slu7Q8BHJ9 585 aa22.95■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Cdk8Q8R3L8 464 aa22.95■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Myh8P13542 1937 aa22.95■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Il7P10168 154 aa22.95■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 GscQ02591 256 aa22.95■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Chrna5Q2MKA5 467 aa22.95■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Clec16aQ80U30 1036 aa22.95■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Epha10Q8BYG9 1007 aa22.95■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Tlcd1Q99JT6 247 aa22.95■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Lrrd1Q8C0R9 853 aa22.94■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Filip1Q9CS72 1211 aa22.94■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Tmem47Q9JJG6 181 aa22.94■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Atp12aQ9Z1W8 1035 aa22.94■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Mdh1bQ5F204 500 aa22.94■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Spata32Q8C5V0 334 aa22.94■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Gm11983V9GXS8 105 aa22.94■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Rad23bP54728 416 aa22.93■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Eya3P97480 510 aa22.93■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 DSCC1Q14AI0 399 aa22.93■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Myo19Q5SV80 963 aa22.93■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Tas2r124Q7M718 309 aa22.93■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Ankrd1Q9CR42 319 aa22.93■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Zkscan4Q5SZT6 480 aa22.93■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 DaglaQ6WQJ1 1044 aa22.93■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 WdpcpQ8C456 722 aa22.93■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Nod2Q8K3Z0 1020 aa22.93■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 MarcksP26645 309 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Usp13Q5BKP2 858 aa22.92■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Cep85Q8BMK0 761 aa22.92■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Plekha7Q3UIL6 1118 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Creld2Q9CYA0 350 aa22.92■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Myo1hQ9D6A1 958 aa22.92■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 SsbP32067 415 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Pip5kl1Q6U7H8 395 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Tacc1Q6Y685 774 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Arid5bQ8BM75 1188 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Fam53cQ8BXQ8 393 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Pcdhb5Q91XZ5 792 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Xpo4Q9ESJ0 1151 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 AllcQ9JHX6 414 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Cyp26c1B2RXA7 518 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Gucy1a2F8VQK3 730 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Usp5P56399 858 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Frmd3Q8BHD4 595 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Kiaa1524Q8BWY9 907 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 OplahQ8K010 1288 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Otud6bQ8K2H2 294 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Hexim1Q8R409 356 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Cyp2ab1S4R196 498 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Acad12D3Z7X0 555 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Clic6Q8BHB9 596 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Sox30Q8CGW4 782 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Ints4Q8CIM8 964 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 WaslQ91YD9 501 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Tubgcp2Q921G8 905 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Txnrd3Q99MD6 652 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Fam178bQ24JP3 464 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Armc2Q3URY6 854 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Luc7l2Q7TNC4 392 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Znf18Q810A1 556 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Gga3Q8BMI3 718 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 RabggtaQ9JHK4 567 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Sned1Q70E20 1403 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Nfil3O08750 462 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Alppl2P24823 529 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Kiaa1468Q148V7 1216 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Vps53Q8CCB4 832 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Ecm29Q6PDI5 1840 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Cdc27A2A6Q5 825 aa22.89■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Usp17lbE9Q9U0 468 aa22.89■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Adam7O35227 789 aa22.89■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Slc7a1Q09143 622 aa22.89■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Cd2apQ9JLQ0 637 aa22.89■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Dctpp1Q9QY93 170 aa22.89■■□□□ 1.26
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 StrcQ8VIM6 1809 aa22.89■■□□□ 1.25
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Api5O35841 504 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Q8C6G1 249 aa22.89■■□□□ 1.25
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Lmbr1Q9JIT0 490 aa22.89■■□□□ 1.25
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Ubxn8Q9QZ49 277 aa22.89■■□□□ 1.25
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 A0A0U1RNP2 1173 aa22.88■■□□□ 1.25
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 UncxO08934 530 aa22.88■■□□□ 1.25
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 GnaqP21279 359 aa22.88■■□□□ 1.25
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Myh7bA2AQP0 1941 aa22.88■■□□□ 1.25
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Fam186bD3Z420 943 aa22.88■■□□□ 1.25
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Zscan18E9PUD6 809 aa22.88■■□□□ 1.25
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Nell2Q61220 819 aa22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.3 ms