RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008297.4

Clstn3-201, Transcript of Calsyntenin-3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clstn3, Length 4,014 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Myo3bQ1EG27 1305 aa10.53□□□□□ -0.72
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pik3c2aQ61194 1686 aa10.53□□□□□ -0.72
Clstn3-201ENSMUST00000008297 ByslO54825 436 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Il7P10168 154 aa10.53□□□□□ -0.72
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Arhgef16Q3U5C8 713 aa10.53□□□□□ -0.72
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gucy2cQ3UWA6 1072 aa10.53□□□□□ -0.72
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Glg1Q61543 1175 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gpbp1Q6NXH3 473 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Asic3Q6X1Y6 530 aa10.53□□□□□ -0.72
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Sval3Q76I99 144 aa10.53□□□□□ -0.72
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cfap100Q80VN0 613 aa10.53□□□□□ -0.72
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm5580A0A0N4SVP8 411 aa10.52□□□□□ -0.72
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm5934D3Z4U6 212 aa10.52□□□□□ -0.72
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Usp53P15975 1069 aa10.52□□□□□ -0.72
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Znf667Q2TL60 609 aa10.52□□□□□ -0.72
Clstn3-201ENSMUST00000008297 VrtnQ3SYK4 740 aa10.52□□□□□ -0.72
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Prl2c1Q5SVL9 228 aa10.52□□□□□ -0.72
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cyp4x1Q6A152 507 aa10.52□□□□□ -0.72
Clstn3-201ENSMUST00000008297 AdpgkQ8VDL4 496 aa10.52□□□□□ -0.72
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Hps4Q99KG7 671 aa10.52□□□□□ -0.72
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Thap2Q9D305 217 aa10.52□□□□□ -0.72
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nap1l5Q9JJF0 156 aa10.52□□□□□ -0.72
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Map2P20357 1828 aa10.52□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 C3P01027 1663 aa10.52□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Otud7bB2RUR8 840 aa10.52□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Casp12O08736 419 aa10.52□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cyp2d9P11714 504 aa10.52□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mdh1P14152 334 aa10.52□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccdc148Q6P5U8 527 aa10.52□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Sept9Q80UG5 583 aa10.52□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fam177a1Q8BR63 207 aa10.52□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fermt2Q8CIB5 680 aa10.52□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccdc14Q8K2J4 934 aa10.52□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Erlin1Q91X78 346 aa10.52□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 St5Q924W7 1134 aa10.52□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Dydc1Q9D9T0 175 aa10.52□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Acad12D3Z7X0 555 aa10.52□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Slc7a1Q09143 622 aa10.52□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tc2nQ91XT6 489 aa10.52□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Filip1Q9CS72 1211 aa10.52□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fam217aQ9D9W6 419 aa10.52□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gja10Q9WUS4 505 aa10.52□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Wdr19Q3UGF1 1341 aa10.52□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Kcnh4A2A5F7 1018 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rgs22G3UYX5 1258 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Celf1P28659 486 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Il15P48346 162 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cdr2P97817 455 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Eme2Q56A04 373 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Madcam1Q61826 405 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mcm7Q61881 719 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ddx10Q80Y44 875 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cep85Q8BMK0 761 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cc2d1bQ8BRN9 848 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Slx1bQ8BX32 270 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Stag1Q9D3E6 1258 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccdc105Q9D4K7 499 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Etnk1Q9D4V0 363 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Q9D5Q8 446 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Copb1Q9JIF7 953 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 EcsitQ9QZH6 435 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Spocd1B1ASB6 936 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Dnajc21E9Q8D0 531 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Prpf38aQ4FK66 312 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Arhgef2Q60875 985 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Spata32Q8C5V0 334 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 EhhadhQ9DBM2 718 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Adarb2Q9JI20 745 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tacc2Q9JJG0 1149 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gpaa1Q9WTK3 621 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Arfgef2A2A5R2 1792 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm1993A6X8I0 212 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Apol7aB2RT54 418 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 SlxD3Z347 212 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nfxl1E9Q8I7 918 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccdc42Q5SV66 316 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 SltmQ8CH25 1031 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mfap3lQ9D3X9 409 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ercc4Q9QZD4 917 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 CpdO89001 1377 aa10.51□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cyp3a25O09158 503 aa10.5□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Hdhd2Q3UGR5 259 aa10.5□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ttll4Q80UG8 1193 aa10.5□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Sdad1Q80UZ2 687 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Krt222Q8CCX5 294 aa10.5□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm28042B7ZCM9 1014 aa10.5□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Hmgb1P63158 215 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cct5P80316 541 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Kiaa1468Q148V7 1216 aa10.5□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Armc2Q3URY6 854 aa10.5□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Znf496Q5SXI5 585 aa10.5□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rbm12b2Q66JV4 834 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Commd10Q8JZY2 202 aa10.5□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Adcy3Q8VHH7 1145 aa10.5□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Xrcc4Q924T3 326 aa10.5□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Sar1bQ9CQC9 198 aa10.5□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nek3Q9R0A5 511 aa10.5□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 LbrQ3U9G9 626 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ces3aQ63880 571 aa10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.9 ms