RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637500.1

TCF4-287, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 100 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-287	ENST00000637500	SLURP1	P55000	103 aa		2.58	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	CPZ	Q66K79	652 aa		2.58	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	C12orf40	Q86WS4	652 aa		2.58	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	CREG2	Q8IUH2	290 aa		2.58	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		2.58	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	KCT2	Q8NC54	265 aa		2.58	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		2.58	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		2.58	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	CSAD	Q9Y600	493 aa		2.58	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	OR14I1	A6ND48	311 aa		2.57	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	C6	P13671	934 aa		2.57	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	TACR2	P21452	398 aa		2.57	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	VIPR1	P32241	457 aa		2.57	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	GDF5	P43026	501 aa		2.57	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	KCNC1	P48547	511 aa		2.57	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	GALK1	P51570	392 aa		2.57	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	PLCB3	Q01970	1234 aa		2.57	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		2.57	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	NLRX1	Q86UT6	975 aa		2.57	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		2.57	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	SULF2	Q8IWU5	870 aa		2.57	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		2.57	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		2.57	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		2.57	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	MZB1	Q8WU39	189 aa		2.57	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		2.57	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		2.57	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	FBRS	Q9HAH7	460 aa		2.57	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		2.57	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		2.57	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		2.57	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		2.56	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	ZNF20	P17024	532 aa		2.56	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	ATP2B4	P23634	1241 aa		2.56	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	CHRNE	Q04844	493 aa		2.56	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		2.56	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	NKG7	Q16617	165 aa		2.56	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	UBXN11	Q5T124	520 aa		2.56	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		2.56	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		2.56	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	FERMT3	Q86UX7	667 aa		2.56	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		2.56	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		2.56	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500		Q96M66	194 aa		2.56	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	PWWP2A	Q96N64	755 aa		2.56	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	MIPEP	Q99797	713 aa		2.56	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		2.56	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	NPHS2	Q9NP85	383 aa		2.56	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	ATG7	O95352	703 aa		2.55	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	BMP6	P22004	513 aa		2.55	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	NME2	P22392	152 aa		2.55	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	EGR3	Q06889	387 aa		2.55	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	MTMR3	Q13615	1198 aa		2.55	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		2.55	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		2.55	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		2.55	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		2.55	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	GPR160	Q9UJ42	338 aa		2.55	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		2.55	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	TRIM37	O94972	964 aa		2.54	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	FAM13A	O94988	1023 aa		2.54	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	FBLN1	P23142	703 aa		2.54	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	GRM2	Q14416	872 aa		2.54	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	ADGRF1	Q5T601	910 aa		2.54	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	LDHD	Q86WU2	507 aa		2.54	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	ZNF575	Q86XF7	245 aa		2.54	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		2.54	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		2.54	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		2.54	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		2.54	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		2.54	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	CYP7A1	P22680	504 aa		2.53	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	TEK	Q02763	1124 aa		2.53	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	VWA3B	Q502W6	1294 aa		2.53	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	SAMD11	Q96NU1	681 aa		2.53	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	DUSP13	Q9UII6	198 aa		2.53	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		2.53	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		2.53	□□□□□ -2
TCF4-287	ENST00000637500	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TCF4-287	ENST00000637500	NOBOX	O60393	691 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TCF4-287	ENST00000637500	ERVFRD-1	P60508	538 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TCF4-287	ENST00000637500	AAMP	Q13685	434 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TCF4-287	ENST00000637500	INPP5A	Q14642	412 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TCF4-287	ENST00000637500	CDSN	Q15517	529 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TCF4-287	ENST00000637500	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TCF4-287	ENST00000637500	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TCF4-287	ENST00000637500	SPRED1	Q7Z699	444 aa		2.52	□□□□□ -2.01

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