RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa29.04■■■□□ 2.24
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CAPNS1-215ENST00000628018 CDKL5O76039 1030 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 KAT14Q9H8E8 782 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 PGAP2Q9UHJ9 254 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 KIF3AQ9Y496 699 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 UTRNP46939 3433 aa29.04■■■□□ 2.24
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CAPNS1-215ENST00000628018 CDAN1Q8IWY9 1227 aa28.99■■■□□ 2.23
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CAPNS1-215ENST00000628018 H3BQV1 296 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-215ENST00000628018 MCM4P33991 863 aa28.94■■■□□ 2.22
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CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM22Q8IYM9 498 aa28.94■■■□□ 2.22
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CAPNS1-215ENST00000628018 DPY19L2Q6NUT2 758 aa28.92■■■□□ 2.22
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CAPNS1-215ENST00000628018 JAG1P78504 1218 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-215ENST00000628018 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-215ENST00000628018 C8orf76Q96K31 380 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-215ENST00000628018 MYH4Q9Y623 1939 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-215ENST00000628018 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-215ENST00000628018 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-215ENST00000628018 DEXIO95424 95 aa28.9■■■□□ 2.22
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