RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608473.5

GTF3C2-AS1-211, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTF3C2-AS1, Length 554 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PALD1Q9ULE6 856 aa10.51□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TNNQ9UQP3 1299 aa10.51□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DOCK2Q92608 1830 aa10.51□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZAP70P43403 619 aa10.5□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MAP3K12Q12852 859 aa10.5□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LHX8Q68G74 356 aa10.5□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ERC1Q8IUD2 1116 aa10.5□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FEZ1Q99689 392 aa10.5□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NUDT12Q9BQG2 462 aa10.5□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP10.5□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 C1orf115Q9H7X2 142 aa10.5□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FLT1P17948 1338 aa10.5□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RPTORQ8N122 1335 aa10.5□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa10.49□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GDF11O95390 407 aa10.49□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CYP2B6P20813 491 aa10.49□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MAPK4P31152 587 aa10.49□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa10.49□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 USP17L2Q6R6M4 530 aa10.49□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa10.49□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TTC6Q86TZ1 520 aa10.49□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ANKLE1Q8NAG6 615 aa10.49□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SOCS4Q8WXH5 440 aa10.49□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CABP5Q9NP86 173 aa10.49□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MORF4L1Q9UBU8 362 aa10.49□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HTTP42858 3142 aa10.49□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DOCK1Q14185 1865 aa10.49□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MS4A1P11836 297 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 USP14P54578 494 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HERVK_113P62684 666 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CCNA1P78396 465 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 WDR78Q5VTH9 848 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 AACSQ86V21 672 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MAGEB6Q8N7X4 407 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MIGA1Q8NAN2 632 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PAGR1Q9BTK6 254 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NBPF3Q9H094 633 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GH2P01242 217 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RGS2P41220 211 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RAB3GAP1Q15042 981 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ADGRA1Q86SQ6 560 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 BCL11AQ9H165 835 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SERPINB13Q9UIV8 391 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GJD2Q9UKL4 321 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 A0A1W2PPC1 479 aa10.46□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 USP17L15C9J2P7 530 aa10.46□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 USP17L13C9JLJ4 530 aa10.46□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 USP17L11C9JVI0 530 aa10.46□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 USP17L18D6R9N7 530 aa10.46□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 USP17L22D6RA61 530 aa10.46□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 USP17L17D6RBQ6 530 aa10.46□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 USP17L19D6RCP7 530 aa10.46□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 USP17L20D6RJB6 530 aa10.46□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HMMRO75330 724 aa10.46□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ERVK-9P63128 1117 aa10.46□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ERVK-24P63145 666 aa10.46□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 USP17L24Q0WX57 530 aa10.46□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ABCB5Q2M3G0 1257 aa10.46□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PLEKHH3Q7Z736 793 aa10.46□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 C7orf61Q8IZ16 206 aa10.46□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 C11orf49Q9H6J7 331 aa10.46□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa10.46□□□□□ -0.73
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CEP290O15078 2479 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MFSD14CQ5VZR4 134 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 OXER1Q8TDS5 423 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TRIB2Q92519 343 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 EHD4Q9H223 541 aa10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms