RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.5■■□□□ 1.35
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TRAF4-216ENST00000586813 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
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TRAF4-216ENST00000586813 USP17L15C9J2P7 530 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAF4-216ENST00000586813 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.49■■□□□ 1.35
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TRAF4-216ENST00000586813 USP17L20D6RJB6 530 aa23.49■■□□□ 1.35
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TRAF4-216ENST00000586813 OGDHLQ9ULD0 1010 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAF4-216ENST00000586813 APBB1O00213 710 aa23.48■■□□□ 1.35
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TRAF4-216ENST00000586813 APBA2Q99767 749 aa23.48■■□□□ 1.35
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TRAF4-216ENST00000586813 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa23.47■■□□□ 1.35
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TRAF4-216ENST00000586813 ZNF236Q9UL36 1845 aa23.45■■□□□ 1.34
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TRAF4-216ENST00000586813 SEPT2Q15019 361 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAF4-216ENST00000586813 LCORLQ8N3X6 602 aa23.44■■□□□ 1.34
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TRAF4-216ENST00000586813 CYP2D6P10635 497 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAF4-216ENST00000586813 PTPREP23469 700 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAF4-216ENST00000586813 GRB14Q14449 540 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAF4-216ENST00000586813 SLC44A5Q8NCS7 719 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAF4-216ENST00000586813 GDF15Q99988 308 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAF4-216ENST00000586813 ARMT1Q9H993 441 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAF4-216ENST00000586813 PAG1Q9NWQ8 432 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAF4-216ENST00000586813 FLRT1Q9NZU1 646 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAF4-216ENST00000586813 COL6A1P12109 1028 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAF4-216ENST00000586813 ADD2P35612 726 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAF4-216ENST00000586813 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAF4-216ENST00000586813 BOLA2Q9H3K6 86 aa23.39■■□□□ 1.33
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