RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586199.5

ESRRG-223, Transcript of estrogen related receptor gamma, human

TSL 5

Gene ESRRG, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ESRRG-223	ENST00000586199	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	WRNIP1	Q96S55	665 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	GPR25	O00155	361 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	ATP8B2	P98198	1209 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	KCNH2	Q12809	1159 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	NFIA	Q12857	509 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	SPATA5	Q8NB90	893 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	PANK1	Q8TE04	598 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	SSH3	Q8TE77	659 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	FAM151A	Q8WW52	585 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	FKTN	O75072	461 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	TNNI3K	Q59H18	835 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	LYPD8	Q6UX82	237 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	PI16	Q6UXB8	463 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	RAI14	Q9P0K7	980 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	GAK	O14976	1311 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	LILRB3	O75022	631 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	BTD	P43251	543 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	RGS3	P49796	1198 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	GTF2A2	P52657	109 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	GSTO1	P78417	241 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	MECOM	Q03112	1051 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	CCL15	Q16663	113 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	TSC1	Q92574	1164 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	ST8SIA5	O15466	376 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	LDHC	P07864	332 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	CTH	P32929	405 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	MCAM	P43121	646 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	PICALM	Q13492	652 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	CEP85	Q6P2H3	762 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	ERO1B	Q86YB8	467 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	FAM117A	Q9C073	453 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	GPR108	Q9NPR9	543 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	OTOF	Q9HC10	1997 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	ENTPD3	O75355	529 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	CETP	P11597	493 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	INPP5B	P32019	993 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	SH3BP2	P78314	561 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	CRHR2	Q13324	411 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	LINC01559	Q495D7	138 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	PTPN18	Q99952	460 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	IDI2	Q9BXS1	227 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	AAAS	Q9NRG9	546 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	SNRK	Q9NRH2	765 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ESRRG-223	ENST00000586199		J3QL48	77 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ESRRG-223	ENST00000586199	SMPD1	P17405	629 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ESRRG-223	ENST00000586199	PPIL2	Q13356	520 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ESRRG-223	ENST00000586199	SNAPC2	Q13487	334 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ESRRG-223	ENST00000586199	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
ESRRG-223	ENST00000586199	ZNF787	Q6DD87	383 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ESRRG-223	ENST00000586199	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ESRRG-223	ENST00000586199	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ESRRG-223	ENST00000586199	BAP1	Q92560	729 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ESRRG-223	ENST00000586199	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
ESRRG-223	ENST00000586199	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
ESRRG-223	ENST00000586199	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ESRRG-223	ENST00000586199	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		11.58	□□□□□ -0.56

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms