RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-204	ENST00000577468	CXorf38	Q8TB03	319 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	BORCS6	Q96GS4	357 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	CYP7A1	P22680	504 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	CAP2	P40123	477 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	KIR3DL1	P43629	444 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	ZNF385B	Q569K4	471 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-204	ENST00000577468	RFXAP	O00287	272 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	ESR1	P03372	595 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	HK2	P52789	917 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	ERVFC1	P60507	584 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	ARHGAP4	P98171	946 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	LRRC14	Q15048	493 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	LILRA2	Q8N149	483 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	MIPEP	Q99797	713 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	BCO2	Q9BYV7	579 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	CEP44	Q9C0F1	390 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	RNF32	Q9H0A6	362 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468		H3BRB1	525 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	GPR182	O15218	404 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	CBX7	O95931	251 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	IGHA2	P01877	340 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	BMP6	P22004	513 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	TMC1	Q8TDI8	760 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	SASH1	O94885	1247 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	TNK2	Q07912	1038 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	OXR1	Q8N573	874 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	SP110	Q9HB58	689 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	KCTD3	Q9Y597	815 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	TRIM13	O60858	407 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	ADRB1	P08588	477 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	CELA3B	P08861	270 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	FAM193A	P78312	1265 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	NR0B2	Q15466	257 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	HDX	Q7Z353	690 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	ZNF605	Q86T29	641 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	GGN	Q86UU5	652 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	CREG2	Q8IUH2	290 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	HID1	Q8IV36	788 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	RIN3	Q8TB24	985 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	FBRS	Q9HAH7	460 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	FITM1	A5D6W6	292 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	ENC1	O14682	589 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	CLGN	O14967	610 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PTPRM-204	ENST00000577468	NFKB2	Q00653	900 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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