RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574070.5

CLDN7-207, Transcript of claudin 7, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CLDN7, Length 485 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7-207ENST00000574070 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
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CLDN7-207ENST00000574070 C19orf81C9J6K1 198 aa20.54■□□□□ 0.88
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CLDN7-207ENST00000574070 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.52■□□□□ 0.88
CLDN7-207ENST00000574070 TREML2Q5T2D2 321 aa20.52■□□□□ 0.88
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CLDN7-207ENST00000574070 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.52■□□□□ 0.88
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CLDN7-207ENST00000574070 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CLDN7-207ENST00000574070 TOMM22Q9NS69 142 aa20.51■□□□□ 0.87
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CLDN7-207ENST00000574070 TSPY3P0CV98 308 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN7-207ENST00000574070 TSPY8P0CW00 308 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN7-207ENST00000574070 CYP2C8P10632 490 aa20.5■□□□□ 0.87
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CLDN7-207ENST00000574070 BMP2KLQ5H9B9 411 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN7-207ENST00000574070 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN7-207ENST00000574070 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CLDN7-207ENST00000574070 DSCC1Q9BVC3 393 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN7-207ENST00000574070 ZMYM6O95789 1325 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN7-207ENST00000574070 PTPRFP10586 1907 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN7-207ENST00000574070 ZNF213O14771 459 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN7-207ENST00000574070 TLR2O60603 784 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN7-207ENST00000574070 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CLDN7-207ENST00000574070 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CLDN7-207ENST00000574070 IL25Q9H293 177 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN7-207ENST00000574070 SH2D4AQ9H788 454 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN7-207ENST00000574070 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN7-207ENST00000574070 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.49■□□□□ 0.87
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CLDN7-207ENST00000574070 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.49■□□□□ 0.87
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CLDN7-207ENST00000574070 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN7-207ENST00000574070 CPA4Q9UI42 421 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN7-207ENST00000574070 CTNNA3Q9UI47 895 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN7-207ENST00000574070 TSPY2A6NKD2 308 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN7-207ENST00000574070 RAD21O60216 631 aa20.47■□□□□ 0.87
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CLDN7-207ENST00000574070 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
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CLDN7-207ENST00000574070 CASC1Q6TDU7 716 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN7-207ENST00000574070 INCENPQ9NQS7 918 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN7-207ENST00000574070 A0A1W2PRG0 241 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN7-207ENST00000574070 SGSM2O43147 1006 aa20.46■□□□□ 0.87
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CLDN7-207ENST00000574070 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CLDN7-207ENST00000574070 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN7-207ENST00000574070 ERO1AQ96HE7 468 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN7-207ENST00000574070 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN7-207ENST00000574070 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
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CLDN7-207ENST00000574070 C12orf42Q96LP6 360 aa20.45■□□□□ 0.86
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CLDN7-207ENST00000574070 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CLDN7-207ENST00000574070 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
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CLDN7-207ENST00000574070 KIF22Q14807 665 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN7-207ENST00000574070 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN7-207ENST00000574070 C17orf99Q6UX52 265 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN7-207ENST00000574070 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN7-207ENST00000574070 GOPCQ9HD26 462 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN7-207ENST00000574070 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN7-207ENST00000574070 TMX2Q9Y320 296 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN7-207ENST00000574070 USP17L15C9J2P7 530 aa20.43■□□□□ 0.86
CLDN7-207ENST00000574070 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.43■□□□□ 0.86
CLDN7-207ENST00000574070 USP17L11C9JVI0 530 aa20.43■□□□□ 0.86
CLDN7-207ENST00000574070 USP17L18D6R9N7 530 aa20.43■□□□□ 0.86
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