RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568586.5

RAB40C-211, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB40C, Length 648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-211ENST00000568586 C16orf86Q6ZW13 317 aa35.3■■■■□ 3.24
RAB40C-211ENST00000568586 AMOTL1Q8IY63 956 aa35.3■■■■□ 3.24
RAB40C-211ENST00000568586 ACER1Q8TDN7 264 aa35.3■■■■□ 3.24
RAB40C-211ENST00000568586 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa35.29■■■■□ 3.24
RAB40C-211ENST00000568586 SMIM22K7EJ46 135 aa35.29■■■■□ 3.24
RAB40C-211ENST00000568586 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
RAB40C-211ENST00000568586 PRKCZQ05513 592 aa35.29■■■■□ 3.24
RAB40C-211ENST00000568586 TMEM179Q6ZVK1 233 aa35.29■■■■□ 3.24
RAB40C-211ENST00000568586 EXOC6Q8TAG9 804 aa35.29■■■■□ 3.24
RAB40C-211ENST00000568586 CCDC17Q96LX7 622 aa35.29■■■■□ 3.24
RAB40C-211ENST00000568586 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
RAB40C-211ENST00000568586 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
RAB40C-211ENST00000568586 CDK8P49336 464 aa35.28■■■■□ 3.24
RAB40C-211ENST00000568586 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
RAB40C-211ENST00000568586 POTEFA5A3E0 1075 aa35.27■■■■□ 3.24
RAB40C-211ENST00000568586 GPAA1O43292 621 aa35.27■■■■□ 3.24
RAB40C-211ENST00000568586 GNAT2P19087 354 aa35.27■■■■□ 3.24
RAB40C-211ENST00000568586 HERVK_113P62684 666 aa35.27■■■■□ 3.24
RAB40C-211ENST00000568586 RAET1EQ8TD07 263 aa35.27■■■■□ 3.24
RAB40C-211ENST00000568586 SH3TC2Q8TF17 1288 aa35.27■■■■□ 3.24
RAB40C-211ENST00000568586 FEZ1Q99689 392 aa35.27■■■■□ 3.24
RAB40C-211ENST00000568586 PDE1AP54750 535 aa35.26■■■■□ 3.24
RAB40C-211ENST00000568586 GABRQQ9UN88 632 aa35.26■■■■□ 3.24
RAB40C-211ENST00000568586 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 IRF5Q13568 498 aa35.25■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 A0A1W2PRG0 241 aa35.24■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 USP17L15C9J2P7 530 aa35.24■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 USP17L13C9JLJ4 530 aa35.24■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 USP17L11C9JVI0 530 aa35.24■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 USP17L18D6R9N7 530 aa35.24■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 USP17L22D6RA61 530 aa35.24■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 USP17L17D6RBQ6 530 aa35.24■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 USP17L19D6RCP7 530 aa35.24■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 USP17L20D6RJB6 530 aa35.24■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 M0R2C6 588 aa35.24■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 GRK4P32298 578 aa35.24■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 USP17L24Q0WX57 530 aa35.24■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa35.24■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 SIAH1Q8IUQ4 282 aa35.24■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 RBPJLQ9UBG7 517 aa35.24■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 AKR1B1P15121 316 aa35.23■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 VCAM1P19320 739 aa35.23■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 FLT3LGP49771 235 aa35.23■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 POTEEQ6S8J3 1075 aa35.23■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa35.23■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 TICAM2Q86XR7 235 aa35.23■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 FSD1Q9BTV5 496 aa35.23■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 TXNRD2Q9NNW7 524 aa35.23■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 IGHDP01880 384 aa35.22■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 COA7Q96BR5 231 aa35.22■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 TMEM106CQ9BVX2 250 aa35.22■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 LBX2Q6XYB7 198 aa35.21■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 SLAIN1Q8ND83 568 aa35.21■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa35.21■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 PXYLP1Q8TE99 480 aa35.21■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 ROBO3Q96MS0 1386 aa35.21■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa35.21■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 EVI5LQ96CN4 794 aa35.2■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 GJD2Q9UKL4 321 aa35.2■■■■□ 3.23
RAB40C-211ENST00000568586 DOCK3Q8IZD9 2030 aa35.2■■■■□ 3.22
RAB40C-211ENST00000568586 TMX2Q9Y320 296 aa35.19■■■■□ 3.22
RAB40C-211ENST00000568586 LNPKQ9C0E8 428 aa35.18■■■■□ 3.22
RAB40C-211ENST00000568586 MYH8P13535 1937 aa35.18■■■■□ 3.22
RAB40C-211ENST00000568586 ADCY3O60266 1144 aa35.17■■■■□ 3.22
RAB40C-211ENST00000568586 NUCB1Q02818 461 aa35.17■■■■□ 3.22
RAB40C-211ENST00000568586 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa35.17■■■■□ 3.22
RAB40C-211ENST00000568586 EN2P19622 333 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
RAB40C-211ENST00000568586 ERVK-9P63128 1117 aa35.16■■■■□ 3.22
RAB40C-211ENST00000568586 ERVK-24P63145 666 aa35.16■■■■□ 3.22
RAB40C-211ENST00000568586 ICA1Q05084 483 aa35.16■■■■□ 3.22
RAB40C-211ENST00000568586 Q3C1V9 767 aa35.16■■■■□ 3.22
RAB40C-211ENST00000568586 CHD1LQ86WJ1 897 aa35.16■■■■□ 3.22
RAB40C-211ENST00000568586 IFNL3Q8IZI9 196 aa35.16■■■■□ 3.22
RAB40C-211ENST00000568586 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
RAB40C-211ENST00000568586 KANSL2Q9H9L4 492 aa35.16■■■■□ 3.22
RAB40C-211ENST00000568586 LPAR1Q92633 364 aa35.15■■■■□ 3.22
RAB40C-211ENST00000568586 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP35.15■■■■□ 3.22
RAB40C-211ENST00000568586 SH2D4AQ9H788 454 aa35.15■■■■□ 3.22
RAB40C-211ENST00000568586 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa35.15■■■■□ 3.22
RAB40C-211ENST00000568586 PEX10O60683 326 aa35.14■■■■□ 3.22
RAB40C-211ENST00000568586 RASA1P20936 1047 aa35.14■■■■□ 3.22
RAB40C-211ENST00000568586 MTFR1Q15390 333 aa35.14■■■■□ 3.22
RAB40C-211ENST00000568586 OSBPL3Q9H4L5 887 aa35.14■■■■□ 3.22
RAB40C-211ENST00000568586 CNMDO75829 334 aa35.13■■■■□ 3.21
RAB40C-211ENST00000568586 MAPK4P31152 587 aa35.13■■■■□ 3.21
RAB40C-211ENST00000568586 TDO2P48775 406 aa35.13■■■■□ 3.21
RAB40C-211ENST00000568586 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa35.13■■■■□ 3.21
RAB40C-211ENST00000568586 CLEC10AQ8IUN9 316 aa35.13■■■■□ 3.21
RAB40C-211ENST00000568586 NACAP1Q9BZK3 213 aa35.13■■■■□ 3.21
RAB40C-211ENST00000568586 MINDY4BA8MYZ0 360 aa35.12■■■■□ 3.21
RAB40C-211ENST00000568586 APPP05067 770 aa35.12■■■■□ 3.21
RAB40C-211ENST00000568586 UBXN2AP68543 259 aa35.12■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms