RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGSF3O75054 1194 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAB11FIP3O75154 756 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 SGPL1O95470 568 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 HMGCRP04035 888 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 VCAM1P19320 739 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 GUCY1A2P33402 732 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERVK-9P63128 1117 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERVK-24P63145 666 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 PDE3AQ14432 1141 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 POTEEQ6S8J3 1075 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHRDL2Q6WN34 429 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRIB2Q92519 343 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRRCC1Q9C099 1032 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 GINM1Q9NU53 330 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 RBPJLQ9UBG7 517 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 MYH7P12883 1935 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 MYH8P13535 1937 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 USP17L15C9J2P7 530 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 USP17L11C9JVI0 530 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 USP17L18D6R9N7 530 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 USP17L22D6RA61 530 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 USP17L19D6RCP7 530 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 USP17L20D6RJB6 530 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATP5JP18859 108 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAPK4P31152 587 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADD2P35612 726 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 USP17L24Q0WX57 530 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCL14Q16627 93 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 Q3C1V9 767 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 HAUS7Q99871 368 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 HTATIP2Q9BUP3 242 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 TANGO6Q9C0B7 1094 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.021e-6■■□□□ 12.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 GJD2Q9UKL4 321 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 CENPFP49454 3210 aa8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1W2PRG0 241 aa8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 CNMDO75829 334 aa8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 AKR1B1P15121 316 aa8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 USP14P54578 494 aa8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATP2B2Q01814 1243 aa8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 GABPAQ06546 454 aa8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPR142Q7Z601 462 aa8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLEKHH3Q7Z736 793 aa8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 STK11IPQ8N1F8 1099 aa8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 SOCS4Q8WXH5 440 aa8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 C12orf42Q96LP6 360 aa8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCDH10Q9P2E7 1040 aa8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-212ENST00000567690 ALPK3Q96L96 1907 aa8.64□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAD21O60216 631 aa8.64□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 RGS2P41220 211 aa8.64□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 ICA1Q05084 483 aa8.64□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa8.64□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa8.64□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 AMOTL1Q8IY63 956 aa8.64□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 C7orf61Q8IZ16 206 aa8.64□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPICE1Q8N0Z3 855 aa8.64□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 APBA2Q99767 749 aa8.64□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 BTBD7Q9P203 1132 aa8.64□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa8.64□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A0G2JMZ2 1700 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPTORQ8N122 1335 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 USP17L12C9JPN9 530 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 USP17L21D6R901 530 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 EVI5O60447 810 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDK8P49336 464 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCNA1P78396 465 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAP2K5Q13163 448 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 MORN1Q5T089 497 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM179Q6ZVK1 233 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-212ENST00000567690 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.63□□□□□ -1.03
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