RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566243.5

EDC3-211, Transcript of enhancer of mRNA decapping 3, humanhuman

TSL 3

Gene EDC3, Length 711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3-211ENST00000566243 CTGFP29279 349 aa22.8■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.8■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.8■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 FEZ1Q99689 392 aa22.8■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.8■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.8■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.8■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 PTPRFP10586 1907 aa22.8■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 A0A1W2PRG0 241 aa22.79■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.79■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.79■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 C12orf42Q96LP6 360 aa22.79■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 CCDC17Q96LX7 622 aa22.79■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 PNMA3Q9UL41 463 aa22.79■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 OSBPP22059 807 aa22.78■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 NAPBQ9H115 298 aa22.78■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 HTTP42858 3142 aa22.78■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.78■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.77■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 RASA1P20936 1047 aa22.77■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 USP14P54578 494 aa22.77■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.77■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.77■■□□□ 1.24
EDC3-211ENST00000566243 ICA1Q05084 483 aa22.76■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 KIF22Q14807 665 aa22.76■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 TTC22Q5TAA0 569 aa22.76■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 TRIM47Q96LD4 638 aa22.76■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.76■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 PRDM1O75626 825 aa22.75■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 VCAM1P19320 739 aa22.75■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 PSMC4P43686 418 aa22.75■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 PPARAQ07869 468 aa22.75■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.75■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 ARHGEF6Q15052 776 aa22.74■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.74■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.74■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 HERVK_113P62684 666 aa22.73■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 ALX1Q15699 326 aa22.73■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.73■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.73■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 TMX2Q9Y320 296 aa22.73■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 USP17L15C9J2P7 530 aa22.72■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.72■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 USP17L11C9JVI0 530 aa22.72■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 USP17L18D6R9N7 530 aa22.72■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 USP17L22D6RA61 530 aa22.72■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.72■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 USP17L19D6RCP7 530 aa22.72■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 USP17L20D6RJB6 530 aa22.72■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 PEX10O60683 326 aa22.72■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 USP17L24Q0WX57 530 aa22.72■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.72■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.72■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.72■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.72■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.72■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 GNRH1P01148 92 aa22.71■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 FGAP02671 866 aa22.71■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 ATP2B2Q01814 1243 aa22.71■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.71■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.71■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.71■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.71■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 INCENPQ9NQS7 918 aa22.71■■□□□ 1.23
EDC3-211ENST00000566243 HIP1O00291 1037 aa22.7■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 FCGRTP55899 365 aa22.7■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.7■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.7■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 SRRDQ9UH36 339 aa22.7■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.7■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.7■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.69■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 PDE4BQ07343 736 aa22.69■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 SKAP1Q86WV1 359 aa22.69■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.69■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 IL25Q9H293 177 aa22.69■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 SH2D4AQ9H788 454 aa22.69■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 VCPKMTQ9H867 229 aa22.69■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.68■■□□□ 1.22
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