RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 CDK8P49336 464 aa36.84■■■■□ 3.49
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CMTM4-204ENST00000563952 GIMAP6Q6P9H5 292 aa36.83■■■■□ 3.49
CMTM4-204ENST00000563952 C16orf86Q6ZW13 317 aa36.83■■■■□ 3.49
CMTM4-204ENST00000563952 MGAMO43451 1857 aa36.83■■■■□ 3.49
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CMTM4-204ENST00000563952 TMEM179Q6ZVK1 233 aa36.82■■■■□ 3.48
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CMTM4-204ENST00000563952 AKR1B1P15121 316 aa36.81■■■■□ 3.48
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CMTM4-204ENST00000563952 USP14P54578 494 aa36.81■■■■□ 3.48
CMTM4-204ENST00000563952 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa36.81■■■■□ 3.48
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CMTM4-204ENST00000563952 C12orf42Q96LP6 360 aa36.79■■■■□ 3.48
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CMTM4-204ENST00000563952 IFNL3Q8IZI9 196 aa36.76■■■■□ 3.48
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CMTM4-204ENST00000563952 HERVK_113P62684 666 aa36.75■■■■□ 3.47
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CMTM4-204ENST00000563952 USP17L11C9JVI0 530 aa36.73■■■■□ 3.47
CMTM4-204ENST00000563952 USP17L18D6R9N7 530 aa36.73■■■■□ 3.47
CMTM4-204ENST00000563952 USP17L22D6RA61 530 aa36.73■■■■□ 3.47
CMTM4-204ENST00000563952 USP17L17D6RBQ6 530 aa36.73■■■■□ 3.47
CMTM4-204ENST00000563952 USP17L19D6RCP7 530 aa36.73■■■■□ 3.47
CMTM4-204ENST00000563952 USP17L20D6RJB6 530 aa36.73■■■■□ 3.47
CMTM4-204ENST00000563952 USP17L24Q0WX57 530 aa36.73■■■■□ 3.47
CMTM4-204ENST00000563952 SH3TC2Q8TF17 1288 aa36.73■■■■□ 3.47
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CMTM4-204ENST00000563952 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa36.65■■■■□ 3.46
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CMTM4-204ENST00000563952 TANGO6Q9C0B7 1094 aa36.65■■■■□ 3.46
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CMTM4-204ENST00000563952 PPARAQ07869 468 aa36.64■■■■□ 3.46
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CMTM4-204ENST00000563952 SPICE1Q8N0Z3 855 aa36.64■■■■□ 3.46
CMTM4-204ENST00000563952 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP36.64■■■■□ 3.46
CMTM4-204ENST00000563952 POTEFA5A3E0 1075 aa36.63■■■■□ 3.45
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