RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563386.5

USP10-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 590 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-208ENST00000563386 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.61■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 MYH8P13535 1937 aa22.61■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.6■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 SBK1Q52WX2 424 aa22.6■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.6■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.6■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 FAM227BQ96M60 508 aa22.6■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.6■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 BCRP11274 1271 aa22.59■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 PDE4AP27815 886 aa22.59■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 PSMC4P43686 418 aa22.59■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.59■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 NAPBQ9H115 298 aa22.59■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.59■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.59■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.59■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.59■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 A0A0D9SFI3 127 aa22.58■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 USP14P54578 494 aa22.58■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 ATP2B2Q01814 1243 aa22.58■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 TRIM47Q96LD4 638 aa22.58■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 CCDC17Q96LX7 622 aa22.58■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.58■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 CTGFP29279 349 aa22.57■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 ICA1Q05084 483 aa22.56■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.56■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 VPS53Q5VIR6 699 aa22.56■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 A0A1W2PRG0 241 aa22.55■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 PRDM1O75626 825 aa22.55■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 SDSP20132 328 aa22.55■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.55■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 RASA1P20936 1047 aa22.54■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 FCGRTP55899 365 aa22.54■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.54■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.54■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.53■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 USP17L15C9J2P7 530 aa22.53■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.53■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 USP17L11C9JVI0 530 aa22.53■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 USP17L18D6R9N7 530 aa22.53■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 USP17L22D6RA61 530 aa22.53■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.53■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 USP17L19D6RCP7 530 aa22.53■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 USP17L20D6RJB6 530 aa22.53■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 PEX10O60683 326 aa22.53■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 VCAM1P19320 739 aa22.53■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 SOX10P56693 466 aa22.53■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 HERVK_113P62684 666 aa22.53■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 PPARAQ07869 468 aa22.53■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 USP17L24Q0WX57 530 aa22.53■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 TICAM2Q86XR7 235 aa22.53■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 C12orf42Q96LP6 360 aa22.53■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.53■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 FOXP2O15409 715 aa22.52■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 RAD21O60216 631 aa22.52■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 GNRH1P01148 92 aa22.52■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 HOXD10P28358 340 aa22.52■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.52■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.52■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.52■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 SH2D4AQ9H788 454 aa22.52■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.52■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 SRRDQ9UH36 339 aa22.52■■□□□ 1.2
USP10-208ENST00000563386 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 PDE4BQ07343 736 aa22.51■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.51■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 TTC22Q5TAA0 569 aa22.51■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.51■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.51■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.51■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 MYPNQ86TC9 1320 aa22.51■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.5■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.5■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.5■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 RAET1EQ8TD07 263 aa22.5■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 TMX2Q9Y320 296 aa22.5■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 PRMT2P55345 433 aa22.49■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 PRKCZQ05513 592 aa22.49■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.49■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.49■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 INCENPQ9NQS7 918 aa22.49■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms