RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 FAM25EA8MYX2 175 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 CDK2AP1O14519 115 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 CD33P20138 364 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 IL4RP24394 825 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 COL8A1P27658 744 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 OAS2P29728 719 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 SOX11P35716 441 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 EML3Q32P44 896 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 GRAMD1BQ3KR37 738 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 AGAP9Q5VTM2 703 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 NLRP13Q86W25 1043 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 NEK9Q8TD19 979 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 BTBD6Q96KE9 485 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 SPAG5Q96R06 1193 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 BRMS1Q9HCU9 246 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 RIC8AQ9NPQ8 531 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 MKS1Q9NXB0 559 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 SLAIN2Q9P270 581 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 GPRASP1Q5JY77 1395 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 C9orf84Q5VXU9 1444 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 MRC2Q9UBG0 1479 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 UNC13BO14795 1591 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 BAIAP3O94812 1187 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 ECEL1O95672 775 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 TATP17735 454 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 SERPINB4P48594 390 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 TNNI2P48788 182 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 TNP2Q05952 138 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 GRIN2CQ14957 1233 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 PPP2R5BQ15173 497 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 ALFQ53S48 1182 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 BICDL1Q6ZP65 573 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 NLRP8Q86W28 1048 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 SNX32Q86XE0 403 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 SH3TC2Q8TF17 1288 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 NELL1Q92832 810 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 E2F7Q96AV8 911 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 ZIC5Q96T25 663 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 KIF2CQ99661 725 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 FAM167BQ9BTA0 163 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 TMOD4Q9NZQ9 345 aa6.4□□□□□ -1.38
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CAPN3-211ENST00000562199 NOD1Q9Y239 953 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 PRAG1Q86YV5 1406 aa6.4□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 GRIN2AQ12879 1464 aa6.4□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 ABCC10Q5T3U5 1492 aa6.4□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 IFT140Q96RY7 1462 aa6.4□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 H0Y3Z8 333 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 SLC27A2O14975 620 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 TSPAN6O43657 245 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 PROCP04070 461 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 VCAM1P19320 739 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 SNX16P57768 344 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 GTF2IP78347 998 aa6.39□□□□□ -1.39
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CAPN3-211ENST00000562199 BIRC3Q13489 604 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 NCOA4Q13772 614 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 FILIP1LQ4L180 1135 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 WDR45BQ5MNZ6 344 aa6.39□□□□□ -1.39
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CAPN3-211ENST00000562199 HYIQ5T013 277 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 PGBD4Q96DM1 585 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 RMDN2Q96LZ7 410 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
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CAPN3-211ENST00000562199 ABCG4Q9H172 646 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 ALG2Q9H553 416 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 TBK1Q9UHD2 729 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 NUP160Q12769 1436 aa6.39□□□□□ -1.39
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