RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 RUFY3Q7L099 469 aa21.99■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 IQCA1Q86XH1 822 aa21.99■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.99■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa21.99■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 SIAH1Q8IUQ4 282 aa21.98■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 KANSL2Q9H9L4 492 aa21.98■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 MTMR4Q9NYA4 1195 aa21.98■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.98■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.98■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 TNKSO95271 1327 aa21.98■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 MYH4Q9Y623 1939 aa21.98■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 UNCXA6NJT0 531 aa21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 USP17L5A8MUK1 530 aa21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 ICA1Q05084 483 aa21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 UBAC1Q9BSL1 405 aa21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 APLP1P51693 650 aa21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 ATP2B2Q01814 1243 aa21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 SEC23AQ15436 765 aa21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 RCSD1Q6JBY9 416 aa21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 ACER1Q8TDN7 264 aa21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 SENP2Q9HC62 589 aa21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 STX8Q9UNK0 236 aa21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZHX2Q9Y6X8 837 aa21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 A0A1W2PRG0 241 aa21.96■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.96■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 NOVP48745 357 aa21.96■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.96■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 ERO1BQ86YB8 467 aa21.96■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 OPTNQ96CV9 577 aa21.96■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 WDR19Q8NEZ3 1342 aa21.95■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 TTLL1O95922 423 aa21.95■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 GJA5P36382 358 aa21.95■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 ECE1P42892 770 aa21.95■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 NEK4P51957 841 aa21.95■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 SART3Q15020 963 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 OTUD5Q96G74 571 aa21.95■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM87BQ96K49 555 aa21.95■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 NYAP2Q9P242 653 aa21.95■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPP2Q13103 211 aa21.94■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCDC178Q5BJE1 867 aa21.94■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 Q6ZUG5 572 aa21.94■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 DGKHQ86XP1 1220 aa21.94■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 MTA3Q9BTC8 594 aa21.94■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 WDR18Q9BV38 432 aa21.94■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 LY9Q9HBG7 655 aa21.94■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.94■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa21.94■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 ERICH2A1L162 156 aa21.93■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPATQ06203 517 aa21.93■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 WTAPQ15007 396 aa21.93■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 RABEP1Q15276 862 aa21.93■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 RGMBQ6NW40 437 aa21.93■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF280CQ8ND82 737 aa21.93■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANKS1AQ92625 1134 aa21.93■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 TTC14Q96N46 770 aa21.93■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM47Q9BQJ4 181 aa21.93■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 AS3MTQ9HBK9 375 aa21.93■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa21.93■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 CREBZFQ9NS37 354 aa21.93■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRIM75PA6NK02 468 aa21.92■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 IRF6O14896 467 aa21.92■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 MKL1Q969V6 931 aa21.92■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 WNK4Q96J92 1243 aa21.92■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 PTPRFP10586 1907 aa21.92■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 TOP1P11387 765 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 FGD1P98174 961 aa21.91■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPIL2Q13356 520 aa21.91■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.91■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.91■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 BRF1Q92994 677 aa21.91■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.91■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMX2Q9Y320 296 aa21.91■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 LIFRP42702 1097 aa21.9■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 DGKZQ13574 1117 aa21.9■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 FEZ1Q99689 392 aa21.9■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 TBC1D2Q9BYX2 928 aa21.9■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 USP17L10C9JJH3 530 aa21.89■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 AK2P54819 239 aa21.89■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 C1QTNF8P60827 252 aa21.89■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 HTRA3P83110 453 aa21.89■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 MTMR2Q13614 643 aa21.89■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPRYD7Q5W111 196 aa21.89■■□□□ 1.1
USP3-AS1-203ENST00000559737 FBXL16Q8N461 479 aa21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms