RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556251.1

RAD51B-223, Transcript of RAD51 paralog B, human

TSL 4

Gene RAD51B, Length 567 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD51B-223	ENST00000556251	IL1R1	P14778	569 aa		6.7	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	PHKA1	P46020	1223 aa		6.7	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	DPYD	Q12882	1025 aa		6.7	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	USP4	Q13107	963 aa		6.7	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	GORAB	Q5T7V8	394 aa		6.7	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		6.7	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		6.7	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		6.7	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		6.7	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	LPIN2	Q92539	896 aa		6.7	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	ZIC5	Q96T25	663 aa		6.7	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		6.7	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		6.7	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		6.7	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		6.7	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		6.7	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251		A0A1B0GUL7	405 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	DKK1	O94907	266 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	FGFR2	P21802	821 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	CRK	P46108	304 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	RAB15	P59190	212 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	PI16	Q6UXB8	463 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	SIX5	Q8N196	739 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	AIDA	Q96BJ3	306 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	XAGE2	Q96GT9	111 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	ABCF2	Q9UG63	623 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	RASSF10	A6NK89	507 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	FOXN1	O15353	648 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	MYO1B	O43795	1136 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	PRDX5	P30044	214 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	TCP10	Q12799	353 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	CCDC102B	Q68D86	513 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	COPRS	Q9NQ92	184 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	PSME4	Q14997	1843 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	CIAO1	O76071	339 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	NF2	P35240	595 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	ECE1	P42892	770 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	ATP8B2	P98198	1209 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	RASA3	Q14644	834 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	ARID5B	Q14865	1188 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	RGMB	Q6NW40	437 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	CEP85	Q6P2H3	762 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	TEKT1	Q969V4	418 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	CDK15	Q96Q40	435 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	SLURP2	P0DP57	97 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	LBX1	P52954	281 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	SEC13	P55735	322 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	PICALM	Q13492	652 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	RASGRF1	Q13972	1273 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	TNNI3K	Q59H18	835 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	JMY	Q8N9B5	988 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RAD51B-223	ENST00000556251	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		6.66	□□□□□ -1.34

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms