RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551206.5

USP15-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 1,022 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-217ENST00000551206 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa15.62■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 ACER1Q8TDN7 264 aa15.62■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa15.62■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa15.62■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 GUCY1A2P33402 732 aa15.61■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 TDO2P48775 406 aa15.61■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 ARHGEF6Q15052 776 aa15.61■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 SH3D19Q5HYK7 790 aa15.61■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 EMILIN3Q9NT22 766 aa15.61■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 HPS5Q9UPZ3 1129 aa15.61■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 MYH7P12883 1935 aa15.6■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 PHIPQ8WWQ0 1821 aa15.6■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 AKR1B1P15121 316 aa15.6■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 OSBPP22059 807 aa15.6■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP15.6■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 GIMAP6Q6P9H5 292 aa15.6■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 USP17L2Q6R6M4 530 aa15.6■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 IFNL3Q8IZI9 196 aa15.6■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 FAM227BQ96M60 508 aa15.6■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 NACAP1Q9BZK3 213 aa15.6■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 PNMA3Q9UL41 463 aa15.6■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 ADGRA2Q96PE1 1338 aa15.6■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 NAV1Q8NEY1 1877 aa15.59■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 PSMC4P43686 418 aa15.59■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 SBK1Q52WX2 424 aa15.59■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 TMEM179Q6ZVK1 233 aa15.59■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 C16orf86Q6ZW13 317 aa15.59■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa15.59■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 OSBPL3Q9H4L5 887 aa15.59■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 MKNK2Q9HBH9 465 aa15.59■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 PTPN22Q9Y2R2 807 aa15.59■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
USP15-217ENST00000551206 BCRP11274 1271 aa15.58■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 PDE4AP27815 886 aa15.58■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 CTGFP29279 349 aa15.58■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 CLEC10AQ8IUN9 316 aa15.58■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 CCDC17Q96LX7 622 aa15.58■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 NAPBQ9H115 298 aa15.58■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 HELLSQ9NRZ9 838 aa15.58■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 TAOK2Q9UL54 1235 aa15.58■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 ATAD5Q96QE3 1844 aa15.58■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 A0A0D9SFI3 127 aa15.57■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 A0A1W2PRG0 241 aa15.57■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 ATP2B2Q01814 1243 aa15.57■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa15.57■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 VPS53Q5VIR6 699 aa15.57■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 TRIM47Q96LD4 638 aa15.57■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa15.57■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 PEX10O60683 326 aa15.56■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 PRDM1O75626 825 aa15.56■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 SDSP20132 328 aa15.56■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 USP14P54578 494 aa15.56■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 FCGRTP55899 365 aa15.56■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 SIAH1Q8IUQ4 282 aa15.56■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 PTPRFP10586 1907 aa15.55■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 ICA1Q05084 483 aa15.55■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa15.55■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa15.55■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 USP17L15C9J2P7 530 aa15.54■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 USP17L13C9JLJ4 530 aa15.54■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 USP17L11C9JVI0 530 aa15.54■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 USP17L18D6R9N7 530 aa15.54■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 USP17L22D6RA61 530 aa15.54■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 USP17L17D6RBQ6 530 aa15.54■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 USP17L19D6RCP7 530 aa15.54■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 USP17L20D6RJB6 530 aa15.54■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 FOXP2O15409 715 aa15.54■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 GNRH1P01148 92 aa15.54■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 EEF2P13639 858 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 VCAM1P19320 739 aa15.54■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 RASA1P20936 1047 aa15.54■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 HOXD10P28358 340 aa15.54■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 SOX10P56693 466 aa15.54■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 HERVK_113P62684 666 aa15.54■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 PPARAQ07869 468 aa15.54■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 USP17L24Q0WX57 530 aa15.54■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 SPICE1Q8N0Z3 855 aa15.54■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 C12orf42Q96LP6 360 aa15.54■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.54■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 KANSL2Q9H9L4 492 aa15.54■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 ZNF287Q9HBT7 754 aa15.54■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 RAD21O60216 631 aa15.53■□□□□ 0.08
USP15-217ENST00000551206 MYCP01106 439 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms