RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa10.92□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 SCYL3Q8IZE3 742 aa10.92□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 STK11IPQ8N1F8 1099 aa10.92□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 SLC44A5Q8NCS7 719 aa10.92□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 SMC1BQ8NDV3 1235 aa10.92□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa10.92□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 MKL1Q969V6 931 aa10.92□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 KLRG1Q96E93 195 aa10.92□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 MAP3K14Q99558 947 aa10.92□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 DNAJC18Q9H819 358 aa10.92□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 KAT14Q9H8E8 782 aa10.92□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa10.92□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 MTMR4Q9NYA4 1195 aa10.92□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 CSADQ9Y600 493 aa10.92□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 SLC12A7Q9Y666 1083 aa10.92□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 TAF6LQ9Y6J9 622 aa10.92□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa10.91□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa10.91□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 ADM5C9JUS6 153 aa10.91□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 DDAH1O94760 285 aa10.91□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 TOMM70O94826 608 aa10.91□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 AKR1B1P15121 316 aa10.91□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 YY1P25490 414 aa10.91□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 ANTXR2P58335 489 aa10.91□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 MAP3K9P80192 1104 aa10.91□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 EVX2Q03828 476 aa10.91□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 SEC23AQ15436 765 aa10.91□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 FAM47AQ5JRC9 791 aa10.91□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 RCSD1Q6JBY9 416 aa10.91□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 CYB5R4Q7L1T6 521 aa10.91□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 PIP4P2Q8N4L2 257 aa10.91□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 C2orf69Q8N8R5 385 aa10.91□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 USP17L5A8MUK1 530 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 GH2P01242 217 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 KIF5BP33176 963 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 GNAQP50148 359 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 AK2P54819 239 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 ICA1Q05084 483 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 FSTL1Q12841 308 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP10.9□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 BRF1Q92994 677 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 WRNIP1Q96S55 665 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 LZTS2Q9BRK4 669 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 LY9Q9HBG7 655 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 INCENPQ9NQS7 918 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 IL17RBQ9NRM6 502 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 STX8Q9UNK0 236 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-220ENST00000550700 C19orf81C9J6K1 198 aa10.89□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 ZBTB43O43298 467 aa10.89□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 USP2O75604 605 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 CDKL5O76039 1030 aa10.89□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 USP14P54578 494 aa10.89□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 RAB3GAP1Q15042 981 aa10.89□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 CHST3Q7LGC8 479 aa10.89□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 CEP95Q96GE4 821 aa10.89□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 WDR18Q9BV38 432 aa10.89□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 GOPCQ9HD26 462 aa10.89□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 TACC3Q9Y6A5 838 aa10.89□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 SMIM22K7EJ46 135 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 KIF3CO14782 793 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 PFKFB2O60825 505 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 CPA1P15085 419 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 SMARCA1P28370 1054 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 PPATQ06203 517 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 SEPT2Q15019 361 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 APOA5Q6Q788 366 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 ERO1BQ86YB8 467 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 CDAN1Q8IWY9 1227 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 ZNF654Q8IZM8 581 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 PNMA1Q8ND90 353 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 LPAR1Q92633 364 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 TMEM47Q9BQJ4 181 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP10.88□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 CLIP2Q9UDT6 1046 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 TMX2Q9Y320 296 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-220ENST00000550700 KIF3AQ9Y496 699 aa10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms