RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548122.2

PTPRB-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 4,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-206ENST00000548122 SIRT2Q8IXJ6 389 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 CLMNQ96JQ2 1002 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 EFCC1Q9HA90 598 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 TLL2Q9Y6L7 1015 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 AK9Q5TCS8 1911 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC171Q6TFL3 1326 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 TFAP4Q01664 338 aa6.42□□□□□ -1.38
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PTPRB-206ENST00000548122 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
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PTPRB-206ENST00000548122 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.42□□□□□ -1.38
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PTPRB-206ENST00000548122 HSCBQ8IWL3 235 aa6.42□□□□□ -1.38
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PTPRB-206ENST00000548122 MRIQ9BWK5 157 aa6.41□□□□□ -1.38
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PTPRB-206ENST00000548122 TBC1D8O95759 1140 aa6.41□□□□□ -1.38
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PTPRB-206ENST00000548122 TTC22Q5TAA0 569 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 TMEM179Q6ZVK1 233 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 NBPF11Q86T75 865 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 IFNL3Q8IZI9 196 aa6.41□□□□□ -1.38
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PTPRB-206ENST00000548122 CATIPQ7Z7H3 387 aa6.41□□□□□ -1.38
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PTPRB-206ENST00000548122 HOMER1Q86YM7 354 aa6.4□□□□□ -1.38
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PTPRB-206ENST00000548122 CHURC1Q8WUH1 139 aa6.4□□□□□ -1.38
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PTPRB-206ENST00000548122 TRAF1Q13077 416 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 PPIL2Q13356 520 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 WTAPQ15007 396 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 NSMFQ6X4W1 530 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
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