RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545764.1

TCP1-216, Transcript of t-complex 1, human

TSL 2

Gene TCP1, Length 709 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCP1-216	ENST00000545764	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764		F6X3S4	739 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	F13A1	P00488	732 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	FUT4	P22083	530 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	ASB11	Q8WXH4	323 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	TMEM87B	Q96K49	555 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	BPNT1	O95861	308 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	RECK	O95980	971 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	GART	P22102	1010 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	CFP	P27918	469 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	ZNF76	P36508	570 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	RAP1GAP	P47736	663 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	CLCN7	P51798	805 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	PLCL1	Q15111	1095 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	RNF34	Q969K3	372 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TCP1-216	ENST00000545764	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	PLCG1	P19174	1290 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	CYP7A1	P22680	504 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	CD96	P40200	585 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	MPP2	Q14168	576 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	GGT7	Q9UJ14	662 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	PRR33	A8MZF0	331 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	KIR3DL1	P43629	444 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	CTSW	P56202	376 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	CDH24	Q86UP0	819 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	MFSD4A	Q8N468	514 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	COPRS	Q9NQ92	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	GREM1	O60565	184 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	TCF3	P15923	654 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	ETV3	P41162	512 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	FANCC	Q00597	558 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	FAM13C	Q8NE31	585 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	CBX7	O95931	251 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	ZP2	Q05996	745 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	IKZF1	Q13422	519 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	REC114	Q7Z4M0	266 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	FBXO27	Q8NI29	283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	FAM168A	Q92567	244 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	LRRC3	Q9BY71	257 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCP1-216	ENST00000545764	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms