RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538433.5

PPFIBP1-208, Transcript of PPFIA binding protein 1, human

TSL 3

Gene PPFIBP1, Length 609 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPFIBP1-208	ENST00000538433	BPNT1	O95861	308 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ESR1	P03372	595 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PSMD2	Q13200	908 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CREG2	Q8IUH2	290 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MYLIP	Q8WY64	445 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DIRC2	Q96SL1	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TMEM253	P0C7T8	217 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CFP	P27918	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	HK2	P52789	917 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FAM13C	Q8NE31	585 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DUSP13	Q9UII6	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPFIBP1-208	ENST00000538433	HPX	P02790	462 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	C1QTNF9	P0C862	333 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PLCG1	P19174	1290 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ITGAE	P38570	1179 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GAB4	Q2WGN9	574 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PHC3	Q8NDX5	983 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433		Q96M66	194 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PARP2	Q9UGN5	583 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LTK	P29376	864 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DAB2	P98082	770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	EGR3	Q06889	387 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	OXR1	Q8N573	874 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RNF141	Q8WVD5	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FITM1	A5D6W6	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CILP	O75339	1184 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SRF	P11831	508 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TNNI2	P48788	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LMNB2	Q03252	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TMC4	Q7Z404	712 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LILRA2	Q8N149	483 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CRELD1	Q96HD1	420 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ASPN	Q9BXN1	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RNF19A	Q9NV58	838 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	KRT1	P04264	644 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GLDC	P23378	1020 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CHMP4BP1	P59074	171 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ERVFC1	P60507	584 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PWP1	Q13610	501 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	C1QL4	Q86Z23	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	USP31	Q70CQ4	1352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FAM221A	A4D161	298 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	WASH4P	A8MWX3	477 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	F13A1	P00488	732 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CHRNE	Q04844	493 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DUSP4	Q13115	394 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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