RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532557.5

MDP1-208, Transcript of magnesium dependent phosphatase 1, human

TSL 2

Gene MDP1, Length 562 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDP1-208	ENST00000532557	MKL1	Q969V6	931 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	CEP95	Q96GE4	821 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	NYAP2	Q9P242	653 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	NMT2	O60551	498 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	TTLL1	O95922	423 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	GH2	P01242	217 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	CALM1	P0DP23	149 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	CALM2	P0DP24	149 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	CALM3	P0DP25	149 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	SLURP2	P0DP57	97 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	FGD1	P98174	961 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	TROAP	Q12815	778 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	CUL4A	Q13619	759 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	CHADL	Q6NUI6	762 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	USP48	Q86UV5	1035 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	TMX3	Q96JJ7	454 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	CABP5	Q9NP86	173 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	PTPRF	P10586	1907 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	CCDC69	A6NI79	296 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	KIF3C	O14782	793 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	PFKFB2	O60825	505 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	GDF11	O95390	407 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	SNHG28	P0DPA3	235 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	JAG1	P78504	1218 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	ICA1	Q05084	483 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	ME3	Q16798	604 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	GTF3C6	Q969F1	213 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	WRNIP1	Q96S55	665 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	SENP2	Q9HC62	589 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	STX8	Q9UNK0	236 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MDP1-208	ENST00000532557	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	ZBTB43	O43298	467 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	LARGE1	O95461	756 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	APOBR	Q0VD83	1088 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	SEPT2	Q15019	361 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	PNMA1	Q8ND90	353 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	WDR18	Q9BV38	432 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	SH2D4A	Q9H788	454 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	KAT14	Q9H8E8	782 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	TMX2	Q9Y320	296 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	PASK	Q96RG2	1323 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	INPP5B	P32019	993 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	MAP3K9	P80192	1104 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	ST3GAL1	Q11201	340 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	GMCL1	Q96IK5	515 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	USP17L5	A8MUK1	530 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	PTPRA	P18433	802 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	SMARCA1	P28370	1054 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MDP1-208	ENST00000532557	KIF5B	P33176	963 aa		10.62	□□□□□ -0.71

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