RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 MGAMO43451 1857 aa22.45■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 PEX10O60683 326 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 TRIM47Q96LD4 638 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 A0A0D9SFI3 127 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 A0A1W2PRG0 241 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 C19orf81C9J6K1 198 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 FOXP2O15409 715 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 PSMC4P43686 418 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 SOX10P56693 466 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 KIF22Q14807 665 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 PNMA3Q9UL41 463 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 GNAT2P19087 354 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 OSBPP22059 807 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 SBK1Q52WX2 424 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 VPS53Q5VIR6 699 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 BRCA2P51587 3418 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 PRDM1O75626 825 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 VCAM1P19320 739 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 ICA1Q05084 483 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 C12orf42Q96LP6 360 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 NAPBQ9H115 298 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRU-211ENST00000531385 RASA1P20936 1047 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 HERVK_113P62684 666 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 ARHGEF6Q15052 776 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 USP14P54578 494 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 FCGRTP55899 365 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 ATP2B2Q01814 1243 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 PRKCZQ05513 592 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC17Q96LX7 622 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 SRRDQ9UH36 339 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 GABRQQ9UN88 632 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 MYPNQ86TC9 1320 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 SDSP20132 328 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 PPARAQ07869 468 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 USP17L15C9J2P7 530 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 USP17L11C9JVI0 530 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 USP17L18D6R9N7 530 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 USP17L22D6RA61 530 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 USP17L19D6RCP7 530 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 USP17L20D6RJB6 530 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 USP17L24Q0WX57 530 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 INCENPQ9NQS7 918 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 TTC22Q5TAA0 569 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 ARMC5Q96C12 935 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 GNRH1P01148 92 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 SKAP1Q86WV1 359 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 RAET1EQ8TD07 263 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRU-211ENST00000531385 VCPKMTQ9H867 229 aa22.33■■□□□ 1.17
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