RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 NETO1Q8TDF5 533 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 BACH2Q9BYV9 841 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 SLITRK5O94991 958 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 CST3P01034 146 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 PRNPP04156 253 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 CEACAM5P06731 702 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 PLCG1P19174 1290 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 ITIH2P19823 946 aa5.95□□□□□ -1.46
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PTPRC-214ENST00000530727 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 TJP2Q9UDY2 1190 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 CORINQ9Y5Q5 1042 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-214ENST00000530727 MPP2Q14168 576 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 FAM196AQ6ZSG2 479 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-214ENST00000530727 TMEM87BQ96K49 555 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-214ENST00000530727 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 U3KQE9 123 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 FMN1Q68DA7 1419 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 FYCO1Q9BQS8 1478 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 SHROOM2Q13796 1616 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 GNAT3A8MTJ3 354 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 TLR3O15455 904 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 EOMESO95936 686 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 GARTP22102 1010 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 LDLRAD1Q5T700 205 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 SLC6A19Q695T7 634 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 LETMD1Q6P1Q0 360 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 FBXL19Q6PCT2 694 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 FLCNQ8NFG4 579 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP5.93□□□□□ -1.46
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PTPRC-214ENST00000530727 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 FAM214BQ7L5A3 538 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRC-214ENST00000530727 FBXL18Q96ME1 805 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRC-214ENST00000530727 SLC5A6Q9Y289 635 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRC-214ENST00000530727 REC114Q7Z4M0 266 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 FAM13CQ8NE31 585 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM265A0A087WTH1 108 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 SFRP5Q5T4F7 317 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 RIN3Q8TB24 985 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 PCGF6Q9BYE7 350 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 KCNQ5Q9NR82 932 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 KLHL3Q9UH77 587 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 PLAGL2Q9UPG8 496 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 ROBO2Q9HCK4 1378 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 RECKO95980 971 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 YARSP54577 528 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
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PTPRC-214ENST00000530727 HRASLS5Q96KN8 279 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 REV1Q9UBZ9 1251 aa5.91□□□□□ -1.46
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PTPRC-214ENST00000530727 PRKCQQ04759 706 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 BNIP3Q12983 259 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 AOC3Q16853 763 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM201Q5SNT2 666 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 NFXL1Q6ZNB6 911 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 CDH24Q86UP0 819 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 USP48Q86UV5 1035 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 AGBL5Q8NDL9 886 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 RNF34Q969K3 372 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 DRC1Q96MC2 740 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 LRRC3Q9BY71 257 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 VAV3Q9UKW4 847 aa5.9□□□□□ -1.46
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