RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526055.5

TSPAN4-216, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-216ENST00000526055 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 GPAA1O43292 621 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 FSD1Q9BTV5 496 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 CDK8P49336 464 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 PDE1AP54750 535 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 EVX2Q03828 476 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 SEPT2Q15019 361 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 EVI5LQ96CN4 794 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 USP17L15C9J2P7 530 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 USP17L11C9JVI0 530 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 USP17L18D6R9N7 530 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 USP17L22D6RA61 530 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 USP17L19D6RCP7 530 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 USP17L20D6RJB6 530 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 HERVK_113P62684 666 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 PRKCZQ05513 592 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 USP17L24Q0WX57 530 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 ACER1Q8TDN7 264 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 COA7Q96BR5 231 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 GRK4P32298 578 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 IRF5Q13568 498 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 SH2D4AQ9H788 454 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 MGAMO43451 1857 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 VCAM1P19320 739 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 M0R2C6 588 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 AKR1B1P15121 316 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 LBX2Q6XYB7 198 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 LNPKQ9C0E8 428 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 TDO2P48775 406 aa22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 FLT3LGP49771 235 aa22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 NUCB1Q02818 461 aa22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 ICA1Q05084 483 aa22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 LPAR1Q92633 364 aa22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 GABRQQ9UN88 632 aa22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 A0A1W2PRG0 241 aa22.04■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 IGHDP01880 384 aa22.04■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 APPP05067 770 aa22.04■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 UBXN2AP68543 259 aa22.04■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.04■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 TMX2Q9Y320 296 aa22.04■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.04■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 MYH8P13535 1937 aa22.04■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 POTEFA5A3E0 1075 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 MAPK4P31152 587 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 ERVK-9P63128 1117 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 ERVK-24P63145 666 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.02■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 SMIM22K7EJ46 135 aa22.02■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 ADCY3O60266 1144 aa22.02■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.02■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.02■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.02■■□□□ 1.12
TSPAN4-216ENST00000526055 CAPN2P17655 700 aa22.01■■□□□ 1.11
TSPAN4-216ENST00000526055 CCNA1P78396 465 aa22.01■■□□□ 1.11
TSPAN4-216ENST00000526055 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.01■■□□□ 1.11
TSPAN4-216ENST00000526055 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.01■■□□□ 1.11
TSPAN4-216ENST00000526055 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TSPAN4-216ENST00000526055 NAPBQ9H115 298 aa22.01■■□□□ 1.11
TSPAN4-216ENST00000526055 VCPKMTQ9H867 229 aa22.01■■□□□ 1.11
TSPAN4-216ENST00000526055 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TSPAN4-216ENST00000526055 RASA1P20936 1047 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN4-216ENST00000526055 COG2Q14746 738 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN4-216ENST00000526055 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
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