RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.08■■□□□ 1.12
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PTPRK-218ENST00000525459 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22■■□□□ 1.11
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PTPRK-218ENST00000525459 TOP1P11387 765 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PTPRK-218ENST00000525459 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PTPRK-218ENST00000525459 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRK-218ENST00000525459 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRK-218ENST00000525459 SIAH1Q8IUQ4 282 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRK-218ENST00000525459 ANKS1AQ92625 1134 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRK-218ENST00000525459 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PTPRK-218ENST00000525459 VCPKMTQ9H867 229 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRK-218ENST00000525459 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRK-218ENST00000525459 A0A1W2PRG0 241 aa21.98■■□□□ 1.11
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