RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517871.1

RRNAD1-208, Transcript of ribosomal RNA adenine dimethylase domain containing 1, human

TSL 3

Gene RRNAD1, Length 479 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRNAD1-208	ENST00000517871	CDK8	P49336	464 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	NOG	Q13253	232 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	PRKG1	Q13976	671 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	CHST3	Q7LGC8	479 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	ANKS1A	Q92625	1134 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	BRF1	Q92994	677 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	PFKFB2	O60825	505 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	PRDM1	O75626	825 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	SHMT1	P34896	483 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	RCAN1	P53805	252 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	MAP3K10	Q02779	954 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	GRM1	Q13255	1194 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	SENP2	Q9HC62	589 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	TSKS	Q9UJT2	592 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	SLC10A3	P09131	477 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	MAP3K9	P80192	1104 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	GTF3C6	Q969F1	213 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	13.78	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRNAD1-208	ENST00000517871	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	HLA-DOA	P06340	250 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	APOBR	Q0VD83	1088 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	CSRNP1	Q96S65	589 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	FZD1	Q9UP38	647 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	TNKS	O95271	1327 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	TBC1D12	O60347	775 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	AOC2	O75106	756 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	APOA5	Q6Q788	366 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	TMTC2	Q8N394	836 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	CSAD	Q9Y600	493 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	TFAP4	Q01664	338 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	SCRN1	Q12765	414 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	IQCA1	Q86XH1	822 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	DGKH	Q86XP1	1220 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	SLURP2	P0DP57	97 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	WTAP	Q15007	396 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	SPRYD7	Q5W111	196 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	NECAB1	Q8N987	351 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	CCDC17	Q96LX7	622 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	WRNIP1	Q96S55	665 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	TOMM22	Q9NS69	142 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	TSPY2	A6NKD2	308 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	CA12	O43570	354 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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