RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517351.5

TCEA1-202, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 4

Gene TCEA1, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-202ENST00000517351 TMEM179Q6ZVK1 233 aa30.66■■■□□ 2.5
TCEA1-202ENST00000517351 ACER1Q8TDN7 264 aa30.66■■■□□ 2.5
TCEA1-202ENST00000517351 CCDC17Q96LX7 622 aa30.66■■■□□ 2.5
TCEA1-202ENST00000517351 OSBPL3Q9H4L5 887 aa30.66■■■□□ 2.5
TCEA1-202ENST00000517351 MINDY4BA8MYZ0 360 aa30.65■■■□□ 2.5
TCEA1-202ENST00000517351 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa30.65■■■□□ 2.5
TCEA1-202ENST00000517351 GNRH1P01148 92 aa30.65■■■□□ 2.5
TCEA1-202ENST00000517351 AKR1B1P15121 316 aa30.65■■■□□ 2.5
TCEA1-202ENST00000517351 CTGFP29279 349 aa30.65■■■□□ 2.5
TCEA1-202ENST00000517351 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
TCEA1-202ENST00000517351 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
TCEA1-202ENST00000517351 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa30.65■■■□□ 2.5
TCEA1-202ENST00000517351 USP14P54578 494 aa30.64■■■□□ 2.5
TCEA1-202ENST00000517351 IFNL3Q8IZI9 196 aa30.64■■■□□ 2.5
TCEA1-202ENST00000517351 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa30.64■■■□□ 2.5
TCEA1-202ENST00000517351 C12orf42Q96LP6 360 aa30.64■■■□□ 2.5
TCEA1-202ENST00000517351 NACAP1Q9BZK3 213 aa30.64■■■□□ 2.5
TCEA1-202ENST00000517351 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
TCEA1-202ENST00000517351 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
TCEA1-202ENST00000517351 RILPL2Q969X0 211 aa30.63■■■□□ 2.49
TCEA1-202ENST00000517351 TRIM47Q96LD4 638 aa30.63■■■□□ 2.49
TCEA1-202ENST00000517351 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa30.62■■■□□ 2.49
TCEA1-202ENST00000517351 STK11IPQ8N1F8 1099 aa30.62■■■□□ 2.49
TCEA1-202ENST00000517351 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa30.62■■■□□ 2.49
TCEA1-202ENST00000517351 FCGRTP55899 365 aa30.61■■■□□ 2.49
TCEA1-202ENST00000517351 FAM110CQ1W6H9 321 aa30.61■■■□□ 2.49
TCEA1-202ENST00000517351 TICAM2Q86XR7 235 aa30.61■■■□□ 2.49
TCEA1-202ENST00000517351 HELLSQ9NRZ9 838 aa30.61■■■□□ 2.49
TCEA1-202ENST00000517351 HOXD10P28358 340 aa30.6■■■□□ 2.49
TCEA1-202ENST00000517351 PRMT2P55345 433 aa30.6■■■□□ 2.49
TCEA1-202ENST00000517351 ROBO3Q96MS0 1386 aa30.6■■■□□ 2.49
TCEA1-202ENST00000517351 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
TCEA1-202ENST00000517351 NAPBQ9H115 298 aa30.6■■■□□ 2.49
TCEA1-202ENST00000517351 A0A1W2PRG0 241 aa30.59■■■□□ 2.49
TCEA1-202ENST00000517351 CLEC10AQ8IUN9 316 aa30.59■■■□□ 2.49
TCEA1-202ENST00000517351 MKNK2Q9HBH9 465 aa30.59■■■□□ 2.49
TCEA1-202ENST00000517351 SRRDQ9UH36 339 aa30.59■■■□□ 2.49
TCEA1-202ENST00000517351 SOX10P56693 466 aa30.58■■■□□ 2.49
TCEA1-202ENST00000517351 ICA1Q05084 483 aa30.58■■■□□ 2.49
TCEA1-202ENST00000517351 FAM227BQ96M60 508 aa30.58■■■□□ 2.49
TCEA1-202ENST00000517351 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa30.58■■■□□ 2.49
TCEA1-202ENST00000517351 MGAMO43451 1857 aa30.58■■■□□ 2.49
TCEA1-202ENST00000517351 A0A0D9SFI3 127 aa30.57■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 USP17L15C9J2P7 530 aa30.57■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 USP17L13C9JLJ4 530 aa30.57■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 USP17L11C9JVI0 530 aa30.57■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 USP17L18D6R9N7 530 aa30.57■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 USP17L22D6RA61 530 aa30.57■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 USP17L17D6RBQ6 530 aa30.57■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 USP17L19D6RCP7 530 aa30.57■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 USP17L20D6RJB6 530 aa30.57■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 VCAM1P19320 739 aa30.57■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 HERVK_113P62684 666 aa30.57■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 USP17L24Q0WX57 530 aa30.57■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 MYPNQ86TC9 1320 aa30.56■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 RASA1P20936 1047 aa30.56■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa30.56■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 FOXP2O15409 715 aa30.55■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 PDE4AP27815 886 aa30.55■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa30.55■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 SIAH1Q8IUQ4 282 aa30.55■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 ARMC5Q96C12 935 aa30.55■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 KANSL2Q9H9L4 492 aa30.55■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 ZNF287Q9HBT7 754 aa30.55■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 MORF4L1Q9UBU8 362 aa30.55■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 SDSP20132 328 aa30.54■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 VPS53Q5VIR6 699 aa30.54■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa30.54■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 SH2D4AQ9H788 454 aa30.54■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 ATP2B2Q01814 1243 aa30.53■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 PRKCZQ05513 592 aa30.53■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 PPARAQ07869 468 aa30.53■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 RAET1EQ8TD07 263 aa30.53■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 TMX2Q9Y320 296 aa30.53■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 EEF2P13639 858 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 NBPF11Q86T75 865 aa30.52■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP30.52■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 TXNRD2Q9NNW7 524 aa30.52■■■□□ 2.48
TCEA1-202ENST00000517351 PRDM1O75626 825 aa30.51■■■□□ 2.47
TCEA1-202ENST00000517351 RGS19P49795 217 aa30.51■■■□□ 2.47
TCEA1-202ENST00000517351 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
TCEA1-202ENST00000517351 COA7Q96BR5 231 aa30.51■■■□□ 2.47
TCEA1-202ENST00000517351 RBPJLQ9UBG7 517 aa30.51■■■□□ 2.47
TCEA1-202ENST00000517351 GABRQQ9UN88 632 aa30.51■■■□□ 2.47
TCEA1-202ENST00000517351 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
TCEA1-202ENST00000517351 PEX10O60683 326 aa30.5■■■□□ 2.47
TCEA1-202ENST00000517351 PDE4BQ07343 736 aa30.5■■■□□ 2.47
TCEA1-202ENST00000517351 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
TCEA1-202ENST00000517351 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa30.5■■■□□ 2.47
TCEA1-202ENST00000517351 SH3TC2Q8TF17 1288 aa30.5■■■□□ 2.47
TCEA1-202ENST00000517351 LPAR1Q92633 364 aa30.5■■■□□ 2.47
TCEA1-202ENST00000517351 PAGR1Q9BTK6 254 aa30.5■■■□□ 2.47
TCEA1-202ENST00000517351 VCPKMTQ9H867 229 aa30.5■■■□□ 2.47
TCEA1-202ENST00000517351 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa30.49■■■□□ 2.47
TCEA1-202ENST00000517351 ZNF333Q96JL9 665 aa30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms