RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516525.1

RNU6-1337P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1337, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1337P, Length 95 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1337P-201ENST00000516525 UPK3BL2E5RIL1 263 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GRIN3BO60391 1043 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1337P-201ENST00000516525 HTR3BO95264 441 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1337P-201ENST00000516525 AFMP43652 599 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TNNI2P48788 182 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CHMP4BP1P59074 171 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TMCO4Q5TGY1 634 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FAM196AQ6ZSG2 479 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1337P-201ENST00000516525 HS2ST1Q7LGA3 356 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ERMP1Q7Z2K6 904 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1337P-201ENST00000516525 REC114Q7Z4M0 266 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SLFN12Q8IYM2 578 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1337P-201ENST00000516525 POU5F2Q8N7G0 328 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DNAJB8Q8NHS0 232 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TMEM40Q8WWA1 233 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KBTBD4Q9NVX7 518 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1337P-201ENST00000516525 REV1Q9UBZ9 1251 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KLHL3Q9UH77 587 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KCNH3Q9ULD8 1083 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CTNND2Q9UQB3 1225 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GARTP22102 1010 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GDNFP39905 211 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KCNMB1Q16558 191 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LCE3BQ5TA77 95 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FBXL19Q6PCT2 694 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ZSWIM9Q86XI8 627 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PHACTR4Q8IZ21 702 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RNF141Q8WVD5 230 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CCDC74BQ96LY2 380 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ALPK1Q96QP1 1244 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 COPRSQ9NQ92 184 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KCNQ5Q9NR82 932 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GPATCH2Q9NW75 528 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FAM53CQ9NYF3 392 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GGT7Q9UJ14 662 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TLR3O15455 904 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GREM1O60565 184 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GBP1P32455 592 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DTWD2Q8NBA8 298 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FBXO27Q8NI29 283 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KIRREL1Q96J84 757 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 Q96M66 194 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ASPNQ9BXN1 380 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LRRC3Q9BY71 257 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GPR62Q9BZJ7 368 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SLAMF8Q9P0V8 285 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LRRC10BA6NIK2 292 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ATE1O95260 518 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ESR1P03372 595 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 C8AP07357 584 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GLI1P08151 1106 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SRFP11831 508 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RAC2P15153 192 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TMEM67Q5HYA8 995 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CREG2Q8IUH2 290 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TMEM87AQ8NBN3 555 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KREMEN1Q96MU8 473 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KIF2CQ99661 725 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 BRMS1Q9HCU9 246 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GMIPQ9P107 970 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DUSP13Q9UII6 198 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TMEM59LQ9UK28 342 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SLC22A31A6NKX4 558 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 WASH4PA8MWX3 477 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RGS13O14921 159 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DNAJA2O60884 412 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LRRN2O75325 713 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RAG1P15918 1043 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LTKP29376 864 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MCM4P33991 863 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ZNF165P49910 485 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RNF4P78317 190 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 EGR3Q06889 387 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 APOBRQ0VD83 1088 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PKN1Q16512 942 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GAB4Q2WGN9 574 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ARSHQ5FYA8 562 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RALGPS1Q5JS13 557 aa3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms